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基于转录组学分析筛选早期脓毒症患者外周血关键基因及其相关机制研究
文献摘要：
目的 筛选早期脓毒症患者外周血关键基因并探索相关机制,推测其对早期脓毒症的诊断意义.方法 获取早期脓毒症患者外周血及健康人的RNA-Seq数据,通过多算法结合的转录组学分析及下游生物信息学分析,筛选关键基因,探索相关致病机制,并通过操作者工作特征(ROC)分析其诊断意义.结果 通过差异表达分析筛选1566个在早期脓毒症患者外周血表达上调的基因;筛选后的基因高度富集于细胞分泌调控、细菌感染和中性粒细胞活化及其介导的免疫进程等功能通路;基于106个同时高度参与各主要功能通路的基因构建蛋白质互作网络,定位10个核心基因,并进一步结合各基因在中性粒细胞的表达情况最终筛选出ITGAM、TLR2、S100A9、MMP9及S100A12为早期脓毒症的关键基因;ROC分析结果表明,5个关键基因从统计学角度对早期脓毒症均有诊断意义.结论 ITGAM、TLR2、S100A9、MMP9及S100A12为早期脓毒症的关键基因,具有成为早期脓毒症患者外周血分子标志物的潜力;由于外周血在获取及检测方面的便捷性,通过进一步实验以确证上述分子标志物,对于脓毒症诊疗具有重大意义.
文献关键词：
脓毒症;转录组学;差异表达基因;分子标志物;中性粒细胞
中图分类号：
作者姓名：
于帆;韦唯;楼爽;何海洪;周义文
作者机构：
518000 广东 深圳,南方医科大学深圳医院临床检验医学中心
文献出处：
引用格式：
[1]于帆;韦唯;楼爽;何海洪;周义文-.基于转录组学分析筛选早期脓毒症患者外周血关键基因及其相关机制研究)[J].中国急救医学,2022(12):1044-1049
A类：
B类：
转录组学分析,早期脓毒症,关键基因,相关机制,诊断意义,健康人,Seq,多算法,生物信息学分析,选关,致病机制,操作者,作者工作,差异表达分析,细菌感染,细胞活化,高度参与,主要功能,蛋白质互作网络,核心基因,ITGAM,TLR2,S100A9,MMP9,S100A12,血分,分子标志物,便捷性,确证,差异表达基因
AB值：
0.21944
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