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结球甘蓝SET基因家族鉴定与表达分析
文献摘要：
植物SET基因是一类含有SET结构域的高度保守的基因家族,参与调控植物多种生命过程.为探讨结球甘蓝SET基因家族及其表达情况,采用生物信息学方法对SET基因家族进行鉴定,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和半定量PCR(RT-PCR)对SET基因在不同组织中的表达模式进行分析.结果鉴定出28个结球甘蓝SET基因,它们不均匀分布在除1号染色体外的其他8条染色体上,编码蛋白的相对分子质量在29.20～185.16kDa之间,预测等电点在5.02～9.06之间.基因结构分析表明结球甘蓝SET基因有0～23个内含子.系统进化分析将该家族成员分为7个亚族,其中第Ⅱ和第V亚家族成员最多.在7个亚家族中,每个家族挑选1个基因,qRT-PCR结果显示选取的7个SET基因在结球甘蓝的叶片中不表达,而在根、茎、花蕾和花中均有表达,其中花蕾中表达量较高,进一步RT-PCR检测发现其在花粉母细胞时期高度表达.对结球甘蓝SET基因家族进行了鉴定,分析其进化关系和表达模式,可为深入研究该家族基因功能奠定一定的理论基础.
文献关键词：
结球甘蓝;SET结构域;基因家族;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
王丽芳;潘飞;宋江华
作者机构：
安徽农业大学园艺学院,合肥230036
文献出处：
引用格式：
[1]王丽芳;潘飞;宋江华-.结球甘蓝SET基因家族鉴定与表达分析)[J].安徽农业大学学报,2022(03):424-431
A类：
16kDa
B类：
结球甘蓝,SET,基因家族鉴定,表达分析,结构域,生命过程,生物信息学方法,qRT,半定量,不同组织,表达模式,不均匀分布,编码蛋白,相对分子质量,等电点,基因结构,内含子,系统进化分析,亚家族,花蕾,花粉,母细胞,高度表,进化关系,家族基因,基因功能
AB值：
0.247735
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