典型文献
青花菜SKIP基因的克隆与表达分析
文献摘要：
SKIP(SKI-interacting protein)在植物的生长、发育和逆境响应中起着重要作用.以青花菜为材料,在克隆SKIP基因的基础上,利用生物信息学方法进行序列分析,并通过实时荧光定量PCR研究其在生物(寄生霜霉菌、野油菜黄单胞菌)、非生物(NaCl、PEG6000)胁迫下的表达模式.结果表明,青花菜SKIP基因全长为1836 bp,没有内含子;BoiSKIP编码611个氨基酸,具1个SNW/SKI结构域,位于推导蛋白质序列的188-347处;该蛋白质的分子量为69.22 ku,理论等电点为9.15,平均亲水性指数为-1.12,为亲水性蛋白质.系统发育分析结果表明,芸薹属植物的SKIP聚为一组,支持率达100％,BoiSKIP与甘蓝SKIP的关系最近,它们处于同一分支.基因表达分析结果表明,BoiSKIP的表达受NaCl和PEG6000的诱导,表达量分别在诱导24、12 h达到最大;BoiSKIP受寄生霜霉菌和野油菜黄单胞菌的诱导,分别在处理24 h和72 h达到最大值.青花菜SKIP基因的克隆与表达分析,为后续开展该基因在抗逆反应中的功能研究奠定了基础.
文献关键词：
青花菜;系统发育分析;霜霉病;黑腐病
中图分类号：
作者姓名：
韦海忠;潘丽芹;汤紫依;田盛野;何海叶;尹龙飞;郑德伟;张慧娟;蒋明
作者机构：
台州科技职业学院,浙江 台州318020;台州学院 生命科学学院,浙江 台州318000
文献出处：
引用格式：
[1]韦海忠;潘丽芹;汤紫依;田盛野;何海叶;尹龙飞;郑德伟;张慧娟;蒋明-.青花菜SKIP基因的克隆与表达分析)[J].浙江农业学报,2022(05):966-973
A类：
BoiSKIP,SNW
B类：
青花菜,克隆与表达,interacting,protein,逆境响应,利用生物,生物信息学方法,序列分析,寄生,霉菌,野油菜黄单胞菌,非生物,NaCl,PEG6000,胁迫,表达模式,全长,bp,内含子,结构域,蛋白质序列,分子量,ku,等电点,亲水性,系统发育分析,芸薹属,支持率,甘蓝,基因表达分析,抗逆,逆反应,功能研究,霜霉病,黑腐病
AB值：
0.268887
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