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马铃薯bZIP家族的鉴定与表达分析
文献摘要：
为探索马铃薯中bZIP的功能,对马铃薯bZIP基因家族进行鉴定,分析其系统进化关系、染色体定位、植物组织表达模式,并对非生物逆境胁迫条件下的转录组数据进行分析.利用荧光定量PCR技术检测12个bZIP基因在马铃薯根、茎、叶以及在干旱、低钾、高盐、脱落酸(ABA)和H2 O2等胁迫下的表达情况.通过对马铃薯bZIP转录因子进行全基因组检索,得到104个bZIP基因家族成员.其编码的bZIP转录因子保守结构域长度为21～79 aa,相对分子质量为13088.03～88180.52,等电点为5.02～9.96,均属于亲水蛋白质.利用在线软件MEME对bZIP家族成员的蛋白质全长氨基酸序列进行结构分析,并根据其结构进行相似性聚类,共得到20个Motif,其中Motif1存在于104个bZIP中,为bZIP家族的特征基序.根据进化树分析结果,将马铃薯bZIP家族分为10个亚族.基于转录组数据的表达模式分析结果表明,马铃薯bZIP成员广泛参与ABA、盐、干旱等非生物胁迫响应.qPCR分析结果显示,马铃薯bZIP家族成员还能够在低钾、H2 O2胁迫应答中发挥作用.综合分析可知,马铃薯bZIP家族基因广泛参与了非生物胁迫响应,研究结果为马铃薯bZIP家族的功能研究奠定了基础.
文献关键词：
马铃薯;bZIP基因;表达模式;非生物胁迫
中图分类号：
作者姓名：
李想;冯建英;鲁黎明;李立芹
作者机构：
四川农业大学农学院,四川 成都 611130
文献出处：
引用格式：
[1]李想;冯建英;鲁黎明;李立芹-.马铃薯bZIP家族的鉴定与表达分析)[J].江苏农业学报,2022(06):1453-1464
A类：
B类：
马铃薯,bZIP,表达分析,基因家族,系统进化,进化关系,染色体定位,植物组织,组织表达模式,非生物逆境胁迫,胁迫条件,转录组数据,低钾,高盐,脱落酸,ABA,H2,O2,全基因组,保守结构域,aa,相对分子质量,等电点,亲水蛋白质,MEME,全长,氨基酸序列,Motif1,特征基序,进化树分析,表达模式分析,非生物胁迫,胁迫响应,qPCR,胁迫应答,家族基因,功能研究
AB值：
0.279277
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