典型文献
萝卜ALMT基因家族的鉴定与表达
文献摘要：
为探究萝卜铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)家族成员对生物和非生物胁迫的响应,本研究通过生物信息学方法对萝卜ALMT家族成员进行鉴定,并利用转录组数据对其进行表达分析.结果显示,萝卜基因组中包含17个ALMT基因,分布于8条染色体.该家族成员外显子数量为5～7个,预测N-端含有5～6个跨膜结构,在染色体上的分布不均匀.萝卜ALMT基因家族成员启动子上有多种激素响应、胁迫响应、组织和器官生长发育与环境响应的顺式作用元件,表明萝卜ALMT基因家族成员的表达受多种条件的调控.对它们在不同组织和发育时期,以及对Agrobacterium tumefaciens的侵染和重金属(铅、镉和铬)胁迫的响应研究发现,RsALMT1和RsALMT13可能参与抵抗A.tumefaciens的侵染;RsALMT3可能调控叶片气孔的开放,而RsALMT7、RsALMT11和RsALMT14可能调控叶片气孔的关闭;RsALMT15可能参与绿肉萝卜根肉中叶绿素的积累;RsALMT16在抵御铅胁迫过程中发挥重要作用.以上结果将为进一步研究萝卜ALMT家族成员在生物和非生物胁迫响应中的功能与分子机制奠定基础.
文献关键词：
萝卜;ALMT基因家族;系统进化;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
刘同金;徐铭婕;汪精磊;刘良峰;崔群香;包崇来;王长义
作者机构：
金陵科技学院 园艺园林学院,江苏 南京 210038;浙江省农业科学院 蔬菜研究所,浙江 杭州 310021;江宁区农业农村局,江苏南京211100
文献出处：
引用格式：
[1]刘同金;徐铭婕;汪精磊;刘良峰;崔群香;包崇来;王长义-.萝卜ALMT基因家族的鉴定与表达)[J].浙江农业学报,2022(04):746-755
A类：
ALMT,RsALMT1,RsALMT13,RsALMT3,RsALMT7,RsALMT11,RsALMT14,RsALMT15,RsALMT16
B类：
萝卜,基因家族,苹果酸,转运蛋白,非生物胁迫,生物信息学方法,转录组数据,表达分析,员外,外显子,膜结构,分布不均匀,启动子,激素响应,胁迫响应,官生,环境响应,顺式作用元件,不同组织,发育时期,Agrobacterium,tumefaciens,侵染,响应研究,叶片气孔,绿肉,中叶,叶绿素,铅胁迫,系统进化
AB值：
0.252714
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