典型文献
藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析
文献摘要：
以藜麦的高质量基因组为参考,对藜麦锌指同源异型结构域(ZF-HD)转录因子基因CqZF-HD进行全基因组鉴定,并利用生物信息学方法对其编码的蛋白质理化性质、二级结构、亚细胞定位、保守结构域以及基因结构、系统进化关系进行了分析.同时,利用前期转录组测序结果分析了CqZF-HD家族基因在盐胁迫下的表达模式.结果表明,在藜麦中共鉴定出21个ZF-HD转录因子,大部分定位在细胞质,二级结构以无规则卷曲为主,氨基酸序列长度68～284 aa,相对分子质量7.54×103～30.20×103,理论等电点6.01～9.54;每个ZF-HD蛋白都含有ZF或HD保守结构域,系统进化树将其划分为5个亚家族.盐处理下表达分析结果显示,11个CqZF-HD基因响应藜麦盐胁迫,其中8个基因呈上调表达,3个基因呈下调表达,说明ZF-HD家族基因在参与藜麦盐胁迫中发挥着不同的作用.
文献关键词：
藜麦;锌指同源异型结构域(ZF-HD);全基因组;盐胁迫;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
时丕彪;王德领;蒋润枝;李斌;晏军;方迪;闫凯旋;顾闽峰
作者机构：
盐城市新洋农业试验站,江苏 盐城 224049
文献出处：
引用格式：
[1]时丕彪;王德领;蒋润枝;李斌;晏军;方迪;闫凯旋;顾闽峰-.藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析)[J].江苏农业学报,2022(02):304-312
A类：
CqZF
B类：
藜麦,HD,全基因组鉴定,盐胁迫,响应分析,锌指,异型结构,利用生物,生物信息学方法,二级结构,亚细胞定位,保守结构域,基因结构,进化关系,转录组测序,家族基因,表达模式,细胞质,无规则,卷曲,氨基酸序列,aa,相对分子质量,等电点,系统进化树,亚家族,盐处理,表达分析
AB值：
0.233791
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