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兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因生物信息学分析
文献摘要：
根据NCBI收录的绵羊SLC17A8(Solute Carrier Family 17 Member 8)基因序列设计特异性引物,利用PCR技术扩增兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因外显子区,经测序后拼接序列,并对编码区序列以及翻译后蛋白序列进行蛋白结构预测.结果显示,兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因编码区长为1770 bp,编码589个氨基酸.同源性比对显示兰坪乌骨绵羊SLC17A8氨基酸序列与普通绵羊的该基因氨基酸序列同源性达到99.66％,发现有11个突变位点,其中2个错义突变位点,SLC17A8-Exon1 G159A位点编码的氨基酸由Gly(甘氨酸)突变到Glu(谷氨酸);SLC17A8-Exon2 G87A位点编码的氨基酸由Gly突变到Arg(精氨酸).蛋白结构预测显示,SLC17A8蛋白空间结构主要有α螺旋、β转角和无规则卷曲.
文献关键词：
兰坪乌骨绵羊;SLC17A8基因;PCR扩增;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
岳丹;席冬梅;刘兴能;任洪辉;陆颖;张雪;何志辉;邓卫东
作者机构：
云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明 650201;四川省甘孜州畜牧业科学研究所,四川甘孜藏族自治州 626000
文献出处：
引用格式：
[1]岳丹;席冬梅;刘兴能;任洪辉;陆颖;张雪;何志辉;邓卫东-.兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因生物信息学分析)[J].中国畜牧杂志,2022(03):92-98
A类：
兰坪乌骨绵羊,SLC17A8,Exon1,G159A,Exon2,G87A
B类：
生物信息学分析,NCBI,Solute,Carrier,Family,Member,基因序列,序列设计,特异性引物,外显子,子区,拼接,编码区,蛋白结构,结构预测,基因编码,区长,bp,氨基酸序列,序列同源性,突变位点,错义突变,Gly,甘氨酸,变到,Glu,谷氨酸,Arg,精氨酸,无规则,卷曲
AB值：
0.248303
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