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典型文献
马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子遗传多态性分析
文献摘要:
[目的]分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子多态性,确定其等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,以及与家养绵羊的遗传进化关系.[方法]采用PCR-SSCP方法对39只马可·波罗盘羊、159只塔什库尔干羊、72只藏绵羊、76只宁夏滩羊、36只柯尔克孜羊和26只多浪羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因进行检测,对不同绵羊品种产生的差异等位基因进行克隆及测序,并对等位基因单倍型序列进行分析;利用生物信息学在线软件分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码蛋白的理化性质、结构和功能.[结果]试验共获得66个MHC-DRB3等位基因,马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊、柯尔克孜羊和多浪羊的等位基因数分别为23、14、12、12、4和1个.马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊MHC-DRB3基因第2外显子等位基因序列中的核苷酸多态位点分别为74、76、45、49和25个,表明相较于藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊的多态性更高.系统发育分析表明,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊MHC-DRB3基因均呈两支分化;马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊和藏绵羊MHC-DRB3基因单倍型的相似性较高.马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码产物为不稳定亲水性蛋白,二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主,其生物学作用主要在细胞质中体现.[结论]本试验确定了马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,为进一步探究绵羊MHC-DRB3基因的调控机理及进化意义提供材料.
文献关键词:
马可·波罗盘羊;家养绵羊;MHC-DRB3基因;PCR-SSCP;遗传多态性
作者姓名:
张永浩;肖逸;郭丽君;阿布都热合曼·吐尔逊;王玉涛
作者机构:
喀什大学生命与地理科学学院,新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室,喀什844000
文献出处:
引用格式:
[1]张永浩;肖逸;郭丽君;阿布都热合曼·吐尔逊;王玉涛-.马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子遗传多态性分析)[J].中国畜牧兽医,2022(03):962-972
A类:
家养绵羊,DRB3
B类:
波罗,罗盘,盘羊,MHC,外显子,遗传多态性,多态性分析,等位基因,多态位点,遗传进化,进化关系,SSCP,塔什库尔干,藏绵羊,滩羊,柯尔克孜,多浪羊,单倍型,利用生物,编码蛋白,结构和功能,共获,基因序列,系统发育分析,两支,定亲,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,生物学作用,细胞质,调控机理
AB值:
0.138351
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