为研究牦牛SRSF10(Serine/argnine-rich splicing factor 10,SRSF10)基因的结构及功能,以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,克隆牦牛SRSF10基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测.结果表明,美仁牦牛SRSF10基因的CDS区全长789 bp,共编码262个氨基酸;同源性比对发现,牦牛与野牦牛、黄牛之间的SRSF10基因亲缘关系最近(100％),与北极狐最远(97％);牦牛SRSF10蛋白分析显示,SRSF10蛋白内存在2个糖基化位点,1个RRM结构域(74 aa),无跨膜结构域及信号肽区域,其氨基酸等电点11.26,不稳定系数(Ⅱ)101.36,GRAVY=-1.762,预测为稳定的亲水性分泌蛋白;亚细胞定位与核定位预测分析均显示,SRSF10位于细胞核(61.9％),蛋白内共有潜在磷酸化位点63个;SRSF10蛋白高级结构由无规则卷曲(58.02％)、α-螺旋(21.76％)、延伸链(10.69％)和β-转角(9.54％)相互连接而成,主要与同为丝氨酸和富含精氨酸剪接因子、RNA结合蛋白等相关蛋白相互作用.综上所述,SRSF10基因在牦牛脂肪组织中发挥重要作用,该研究结果可为SRSF10基因在牦牛脂肪沉积调控机制的研究提供理论依据,也可为牦牛的遗传育种提供参考.

美仁牦牛;SRSF10基因;生物信息学;脂肪

李歆怡;黄纯;马晓明;喇永福;郭宪;阎萍;潘和平;梁春年

中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州 730050;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室,兰州 730050;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030

中国草食动物科学

[1]李歆怡;黄纯;马晓明;喇永福;郭宪;阎萍;潘和平;梁春年-.牦牛SRSF10基因克隆及生物信息学分析)[J].中国草食动物科学,2022(05):1-8

argnine,美仁牦牛

SRSF10,基因克隆,生物信息学分析,Serine,rich,splicing,结构及功能,脂肪组织,cDNA,编码区,Coding,sequence,CDS,基因序列,全长,bp,同源性,野牦牛,黄牛,亲缘关系,北极狐,最远,蛋白分析,糖基化位点,RRM,aa,跨膜结构域,信号肽,等电点,不稳定系数,GRAVY,亲水性,分泌蛋白,亚细胞定位,核定,定位预测,预测分析,细胞核,磷酸化,无规则,卷曲,相互连接,丝氨酸,精氨酸,剪接因子,结合蛋白,蛋白相互作用,综上所述,脂肪沉积,调控机制,遗传育种

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