典型文献
绵羊CREBRF基因克隆、生物信息学及组织表达分析
文献摘要：
[目的]对绵羊Luman/CREB3募集因子(CREBRF)基因进行克隆和生物信息学分析,并检测其在绵羊不同组织中的表达量,为探究CREBRF基因在绵羊中的生物学功能提供理论参考.[方法]以绵羊卵巢cDNA为模板,通过PCR扩增和克隆绵羊CREBRF基因完整CDS区序列,并进行相似性比对、系统进化树构建及生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR方法检测CREBRF基因在绵羊不同组织中的表达水平.[结果]绵羊CREBRF基因CDS区序列全长1 920 bp,编码639个氨基酸.相似性比对结果表明,绵羊CREBRF氨基酸序列与山羊、牛、人、小鼠、猪、犬、马、鸡、鸭和斑马鱼的相似性分别为99.8％、99.1％、95.4％、93.6％、98.3％、97.5％、98.4％、88.0％、87.5％和61.3％.系统进化树分析结果显示,绵羊与山羊、牛的亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远.生物信息学分析发现,绵羊CREBRF蛋白分子式为C3126H4914N858O1056S21,分子质量为 72.08 ku,等电点(pI)为4.77,半衰期为30 h,肽链N-端为蛋氨酸(Met),不稳定系数为54.83;CREBRF蛋白存在于细胞核内,不具备跨膜性,无信号肽,为亲水性不稳定蛋白.CREBRF蛋白二级结构主要以无规则卷曲(47.57％)为主,其次为α-螺旋(37.09％).实时荧光定量PCR结果显示,CREBRF基因在绵羊不同组织中均有表达,其中在心脏、肾脏和卵巢中表达量显著高于其他组织(P＜0.05).[结论]本试验获得了绵羊CREBRF基因CDS区全长序列,并初步研究了其组织表达规律,为研究绵羊胚胎发育的调控机制及提高繁殖力等提供了材料.
文献关键词：
绵羊;CREBRF基因;生物信息学分析;表达
中图分类号：
作者姓名：
张丽萌;刘爱菊;李闰婷;李玉华;李林;聂晓宁;王林青;陈龙欣
作者机构：
郑州师范学院,分子生物学实验室,郑州450044;郑州师范学院生命科学学院,郑州450044;沧州职业技术学院农牧工程系,沧州061001
文献出处：
引用格式：
[1]张丽萌;刘爱菊;李闰婷;李玉华;李林;聂晓宁;王林青;陈龙欣-.绵羊CREBRF基因克隆、生物信息学及组织表达分析)[J].中国畜牧兽医,2022(05):1599-1609
A类：
CREBRF,Luman,CREB3,C3126H4914N858O1056S21
B类：
基因克隆,组织表达分析,募集,生物信息学分析,不同组织,生物学功能,cDNA,CDS,进化树构建,全长,bp,氨基酸序列,斑马鱼,系统进化树分析,绵羊与山羊,亲缘关系,最远,分子式,分子质量,ku,等电点,pI,半衰期,肽链,蛋氨酸,Met,不稳定系数,细胞核,膜性,信号肽,亲水性,蛋白二级结构,无规则,卷曲,巢中,他组织,表达规律,胚胎发育,调控机制,繁殖力
AB值：
0.246587
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