[目的]对广灵驴脂肪和肥胖相关基因(fat mass and obesity-associated gene,FTO)进行克隆及序列分析,同时检测其在广灵驴各组织中的表达差异,以探究广灵驴FTO基因结构对其生理代谢功能的影响.[方法]运用RT-PCR技术扩增并克隆广灵驴FTO基因CDS序列,进行基因及蛋白质功能分析,同时运用实时荧光定量PCR方法检测FTO基因在广灵驴7种组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌及皮下脂肪)中的差异表达.[结果]广灵驴FTO基因CDS区序列长1 518 bp,编码505个氨基酸,序列提交至NCBI,登录号:MZ169553.广灵驴FTO基因与马、猪、牛、人、羊驼、绵羊和山羊的相似性为99.3％、90.3％、89.5％、90.8％、90.7％、89.2％和89.2％;系统进化树分析发现,广灵驴与马的亲缘关系最近.FTO蛋白分子质量为58.35 ku,理论等电点为5.07,脂肪系数为80.36,不稳定系数为48.82,平均疏水指数为-0.550,为不稳定的酸性亲水蛋白.FTO蛋白无信号肽和跨膜区,主要定位于细胞质中,具有34个磷酸化位点与5个糖基化位点.FTO蛋白二级结构主要以α-螺旋(43.96％)和无规则卷曲(37.82％)为主.实时荧光定量PCR分析发现,FTO基因在广灵驴7个组织中均有表达,其中在肺脏和皮下脂肪中的表达量极显著高于其他组织(P＜().01),在背最长肌中表达量最低.[结论]本试验结果可为下一步基因表达与调控脂肪沉积机制及改善驴肉品质的研究奠定基础.

广灵驴;FTO基因;克隆;生物信息学分析;组织表达

邱丽霞;关家伟;李丽;李武峰;杜敏

山西农业大学生命科学学院,太谷030801;美国华盛顿州立大学动物科学系,普尔曼99164-6310

中国畜牧兽医

[1]邱丽霞;关家伟;李丽;李武峰;杜敏-.广灵驴FTO基因克隆、序列分析及组织差异表达)[J].中国畜牧兽医,2022(01):12-22

广灵驴,MZ169553

FTO,基因克隆,序列分析,组织差异表达,肥胖相关基因,fat,mass,obesity,associated,gene,同时检测,表达差异,基因结构,生理代谢,代谢功能,CDS,蛋白质功能分析,时运,脾脏,肺脏,背最长肌,皮下脂肪,bp,提交,NCBI,登录号,羊驼,绵羊,山羊,系统进化树分析,亲缘关系,分子质量,ku,等电点,不稳定系数,疏水,亲水,信号肽,细胞质,磷酸化,糖基化位点,蛋白二级结构,无规则,卷曲,他组织,基因表达与调控,脂肪沉积,沉积机制,驴肉,肉品质,质的研究,生物信息学分析,组织表达

0.319087