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典型文献
牛源CCR7基因克隆、生物信息学及表达分析
文献摘要:
[目的]探究CC趋化因子受体7(CC chemokine receptor 7,CCR7)基因编码蛋白的生物学特性及其mRNA在健康和炎性奶牛乳腺组织中的表达量.[方法]使用PCR扩增并克隆中国荷斯坦奶牛CCR7基因CDS区,测序后进行相似性比对及系统进化树构建;使用多种生物信息学软件分析CCR7蛋白的组成、理化性质及结构等;使用实时荧光定量PCR技术检测CCR7基因在健康和炎性奶牛乳腺组织中的表达差异.[结果]中国荷斯坦奶牛CCR7基因CDS区全长1 325 bp,与绵羊的相似性较高(95.2%),亲缘关系较近;与鸡的相似性较低(56.4%),亲缘关系较远.CCR7基因编码379个氨基酸,其中亮氨酸含量最多,缬氨酸含量次之,组氨酸和色氨酸含量最低;CCR7蛋白分子质量为14.56 ku,理论等电点为8.89,平均亲水系数为0.640,是一种跨膜疏水性蛋白.CCR7蛋白信号肽切割位点可能存在于第24和25位氨基酸之间.CCR7蛋白二级结构中α-螺旋占比最大,高达51.72%,三级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲.CCR7基因在炎性奶牛乳腺组织中的表达量极显著高于健康乳腺组织(P<0.01),其可能在奶牛乳腺炎的免疫调控中有着重要的作用.[结论]试验成功克隆出牛CCR7基因CDS区序列,并进行了相应的生物信息学分析及组织定量表达,为进一步研究CCR7基因的具体功能提供材料,对于探究CCR7基因在奶牛乳腺炎中的调控功能具有重要的意义.
文献关键词:
奶牛;CCR7基因;克隆;生物信息学分析;表达
作者姓名:
申祥;陈伶慧;姚竞杰;王三虎;白跃宇;张晓建
作者机构:
河南科技学院动物科技学院,新乡453000;河南省动物卫生监督所,郑州410100
文献出处:
引用格式:
[1]申祥;陈伶慧;姚竞杰;王三虎;白跃宇;张晓建-.牛源CCR7基因克隆、生物信息学及表达分析)[J].中国畜牧兽医,2022(04):1244-1252
A类:
B类:
牛源,CCR7,基因克隆,表达分析,趋化因子受体,chemokine,receptor,基因编码,编码蛋白,生物学特性,乳腺组织,隆中,中国荷斯坦奶牛,CDS,系统进化树,进化树构建,生物信息学软件,表达差异,全长,bp,绵羊,亲缘关系,较远,亮氨酸,酸含量,缬氨酸,组氨酸,色氨酸,分子质量,ku,等电点,亲水,疏水性,信号肽,切割位点,蛋白二级结构,三级结构,无规则,卷曲,奶牛乳腺炎,免疫调控,生物信息学分析,定量表达,调控功能
AB值:
0.28333
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