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典型文献
杜泊羊LEF1生物信息学及表达分析
文献摘要:
旨在对杜泊羊LEF1基因进行生物信息学分析和编码蛋白功能特征预测,探究其对毛囊发育的调控机制,及其在毛囊不同发育时期中的表达量.从试验羊场选择2周岁体重相近的5只杜泊母羊,利用生物信息学方法比对绵羊LEF1氨基酸序列与其他物种的亲缘性,分析LEF1蛋白质的理化性质和结构特征;利用实时荧光定量PCR检测其在杜泊羊体测腹部皮肤的表达量.结果表明,杜泊羊LEF1蛋白的氨基酸序列与牛的亲缘关系最近,与小鼠的亲缘关系最远.LEF1基因编码的氨基酸331个;LEF1基因编码的蛋白质分子式C1636H2534N478O481S15,相对分子质量37075.95 ku,理论等电点数值9.52,亲水性平均值-0.906;编码蛋白的二、三级结构主要由无规卷曲(57.7%)和α-螺旋(28.1%)组成,同时包含1个糖基化位点.LEF1基因在杜泊羊毛囊不同发育时期均有表达,在9月和3月高表达,在1月低表达.综上,LEF1基因在杜泊羊毛囊的生长期高表达.
文献关键词:
杜泊羊;LEF1;生物信息学
作者姓名:
王翊帆;王雅艳;李新海
作者机构:
宁夏大学农学院,银川 790021
引用格式:
[1]王翊帆;王雅艳;李新海-.杜泊羊LEF1生物信息学及表达分析)[J].中国草食动物科学,2022(04):13-17
A类:
C1636H2534N478O481S15
B类:
杜泊羊,LEF1,表达分析,生物信息学分析,编码蛋白,蛋白功能,功能特征,特征预测,毛囊发育,调控机制,不同发育时期,羊场,周岁,母羊,利用生物,生物信息学方法,方法比对,绵羊,氨基酸序列,亲缘性,性质和结构,体测,亲缘关系,最远,基因编码,分子式,相对分子质量,ku,等电点,亲水性,三级结构,无规,卷曲,糖基化位点,羊毛,低表达,生长期
AB值:
0.323625
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