典型文献
牦牛HMOX1基因克隆及生物信息学分析
文献摘要：
研究旨在克隆牦牛血红素加氧酶1(HMOX1)基因,并对其进行生物信息学分析.采用牦牛肺脏组织为材料,根据NCBI数据库公布的牦牛的HMOX1基因序列,利用primer 5.0软件进行引物设计,通过PCR扩增的方法克隆HMOX1基因CDS区序列,并利用在线软件对其编码蛋白进行理化性质、疏水性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、二级结构、三级结构、同源性和系统进化树的预测分析.结果显示,牦牛HMOX1基因CDS区包含870个核苷酸,编码289个氨基酸,分子量为32 876.64,理论等电点为6.68;疏水性分析结果显示,该蛋白为亲水性蛋白,存在1个跨膜结构区域,不存在信号肽;亚细胞定位预测可能为胞质蛋白;预测该蛋白有14个丝氨酸磷酸化位点、17个苏氨酸磷酸化位点和11个酪氨酸磷酸化位点;二级结构和三级结构预测以α-螺旋和无规则卷曲为主;同源性分析表明,牦牛与牛的亲缘关系最近.
文献关键词：
牦牛;HMOX1基因;克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
张雅欣;张雅洁;李睿思;唐甜;吴贝宁;麻俊渊;杨妍梅
作者机构：
西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃兰州730030
文献出处：
引用格式：
[1]张雅欣;张雅洁;李睿思;唐甜;吴贝宁;麻俊渊;杨妍梅-.牦牛HMOX1基因克隆及生物信息学分析)[J].现代畜牧兽医,2022(08):10-15
A类：
B类：
牦牛,HMOX1,基因克隆,生物信息学分析,血红素加氧酶,肺脏,NCBI,基因序列,primer,引物设计,CDS,编码蛋白,疏水性,跨膜结构域,信号肽,亚细胞定位,二级结构,三级结构,系统进化树,预测分析,分子量,等电点,亲水性,定位预测,丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸磷酸化,结构预测,无规则,卷曲,同源性分析,亲缘关系
AB值：
0.302934
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