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益生菌大肠埃希菌Nissle1917鞭毛蛋白的结构分析及表位预测
文献摘要：
目的 分析益生菌大肠埃希菌Nissle 1917(EcN)鞭毛蛋白(FliC)的结构,并预测其B和T细胞表位.方法 从GenBank数据库中获取EcN FliC的氨基酸序列.应用ProtParam在线工具分析EcN FliC理化特性,Protscale在线工具分析亲疏水性,PSIPRED软件及DNAstar软件预测分析二级结构,I-TASSER在线软件预测三级结构,DNAstar在线工具中Protean软件和ABCpred软件综合预测B细胞抗原优势表位,细胞毒性T细胞(cytotoxic T cell,CTL)表位预测网站预测T细胞表位.结果 EcN FliC的相对分子质量为60 937.57,化学分子式为C2584H4201N745O940S6,不稳定指数为15.23;亲水性平均值为-0.324,为亲水性蛋白;α螺旋及无规则卷曲是EcN FliC二级结构中的主要结构;预测的三级结构模型具有正确的结构拓扑,可信度高;共筛选出13个B细胞优势表位及3个CTL优势表位.结论 EcN FliC特征分析及表位预测结果为其作为免疫佐剂的应用奠定了基础.
文献关键词：
大肠埃希菌;鞭毛蛋白;生物信息学;理化性质;结构分析;表位预测
中图分类号：
作者姓名：
杨颖;邓永军;张进;区炳明;朱国强;文明
作者机构：
贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州省动物生物制品工程技术研究中心,贵州贵阳550025;肇庆学院生命科学学院,广东肇庆 526061;扬州大学兽医学院,江苏扬州225009
文献出处：
引用格式：
[1]杨颖;邓永军;张进;区炳明;朱国强;文明-.益生菌大肠埃希菌Nissle1917鞭毛蛋白的结构分析及表位预测)[J].中国生物制品学杂志,2022(06):672-677
A类：
Nissle1917,Nissle,EcN,FliC,PSIPRED,C2584H4201N745O940S6
B类：
益生菌,大肠埃希菌,鞭毛蛋白,表位预测,细胞表位,GenBank,氨基酸序列,ProtParam,理化特性,Protscale,亲疏水性,DNAstar,软件预测,预测分析,二级结构,TASSER,三级结构,Protean,ABCpred,细胞毒性,cytotoxic,cell,CTL,测网,相对分子质量,化学分子,分子式,亲水性,无规则,卷曲,主要结构,结构拓扑,可信度,免疫佐剂
AB值：
0.271318
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