典型文献
新冠病毒Nsp1蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达
文献摘要：
目的 Nsp1是新冠病毒的主要毒力因子,介导了病毒在宿主细胞中的免疫逃逸,扩大了病毒感染范围.本研究对Nsp1进行系统生信分析及原核表达,有助于全面理解该蛋白在新冠病毒侵染宿主细胞中的分子机理.方法 采用Pfam、TMHMM、ProtScale、ExPASy和SignalP 4.0等工具对Nsp1的翻译后修饰、理化性质、跨膜螺旋、相互作用网络、同源性及进化特点等进行系统分析;利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-Nsp1并进行原核表达.结果 Nsp1由180个氨基酸组成,分子量19.78 kDa,等电点为5.36,不稳定指数28.83,在哺乳动物中的半衰期约30 h,在大肠杆菌内超过10 h,有12个可能的磷酸化位点和3个O-糖基化位点,无信号肽和跨膜螺旋,亲水性较强;二级结构分析显示,Nsp1中无规则卷曲占比最高(45.00％),其次是a螺旋(25.56％)和延伸链(20.56％),β-转角 占比最低(8.89％);序列对比和进化分析显示,与SARS-CoV-2 Nsp1序列一致性最高的是蝙蝠非典型冠状病毒WIV1(85.0％);原核表达发现Nsp1主要在沉淀中表达,经质谱鉴定目的蛋白就是Nsp1.结论 本研究为新冠病毒Nsp1的表达、纯化及功能分析提供了重要借鉴,有助于进一步揭示Nsp1的生物学功能及开展相关抑制剂和抗病毒药物的研发.
文献关键词：
新冠病毒;Nsp1蛋白;生信分析;结构与功能;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
刘玲;李璟;范蕾;宣焱;杜淼;张德玖;李卓禧;陈晓聪;杨娅男;徐本锦
作者机构：
山西医科大学汾阳学院医学检验系,汾阳 032200;山西医科大学汾阳学院基础医学部,汾阳 032200;青岛大学转化医学研究院,青岛 266021
文献出处：
引用格式：
[1]刘玲;李璟;范蕾;宣焱;杜淼;张德玖;李卓禧;陈晓聪;杨娅男;徐本锦-.新冠病毒Nsp1蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达)[J].中国人兽共患病学报,2022(07):566-576
A类：
Nsp1,WIV1
B类：
新冠病毒,蛋白结构,结构与功能,生物信息学分析,原核表达,毒力因子,宿主,主细胞,免疫逃逸,生信分析,病毒侵染,分子机理,Pfam,TMHMM,ProtScale,ExPASy,SignalP,翻译后修饰,相互作用网络,同源性,分子克隆,克隆技术,技术构建,重组表达,表达载体,pET,22b,氨基酸组成,分子量,kDa,等电点,哺乳动物,半衰期,期约,大肠杆菌,磷酸化,糖基化位点,信号肽,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,进化分析,SARS,CoV,序列一致性,蝙蝠,非典型,质谱鉴定,目的蛋白,功能分析,生物学功能,抗病毒药物
AB值：
0.370258
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