典型文献
生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株抗原表位
文献摘要：
目的 通过生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株的抗原表位,为病毒抗原表位多肽疫苗的设计开发提供依据.方法 以新冠病毒Omicron变异株(GenBank:OM095411.1)为研究对象,利用生物信息学服务器和免疫学工具预测新冠病毒S、M、N、E蛋白的杀伤性T细胞表位、辅助性T细胞表位和线性B细胞表位.同时,基于免疫表位数据库(IEDB)、抗原性预测(Vaxigen)、致敏性预测(AllerTOP)等表位生物学性质分析数据库对候选表位进行生物学性质分析.结果 筛选得到具有抗原性、无毒性或致敏性的杀伤性T细胞表位38个、辅助性T细胞表位15个和线性B细胞表位6个,主要位于S蛋白和M蛋白.结论 抗原表位的预测筛选方法可行,研究筛选出的候选表位,可为开发针对新冠病毒Omicron变异株多肽疫苗提供借鉴.
文献关键词：
严重急性呼吸综合征冠状病毒2;Omicron变异株;抗原表位;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
孙琦;何为;马玥;李渊源;黄转青;杨森;杨飞;张莹;徐风华
作者机构：
解放军总医院医疗保障中心药剂科药学基础研究室,北京 100853;解放军医学院,北京 100853;联勤保障部队药品仪器监督检验总站,北京 100071;武警北京总队医院,北京 100600
文献出处：
引用格式：
[1]孙琦;何为;马玥;李渊源;黄转青;杨森;杨飞;张莹;徐风华-.生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株抗原表位)[J].军事医学,2022(12):896-900,917
A类：
OM095411,Vaxigen,AllerTOP
B类：
生物信息学方法,Omicron,变异株,抗原表位,表位多肽,多肽疫苗,设计开发,新冠病毒,GenBank,利用生物,服务器,免疫学,杀伤性,细胞表位,辅助性,IEDB,抗原性,致敏性,生物学性质,性质分析,选得,无毒性,筛选方法,发针,严重急性呼吸综合征冠状病毒
AB值：
0.227421
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