首站-论文投稿智能助手
典型文献
牛源致脑炎大肠杆菌FimD、PilN蛋白的生物信息学分析和优势B细胞表位预测
文献摘要:
为了筛选出牛源致脑炎大肠杆菌S9922 FimD、PilN蛋白的优势B细胞表位,本试验采用生物信息学分析工具ProtParam、TMHMM、NetPhos、DNASTAR 软件、SOPMA、SWISS-MODEL、BepiPred、Immunomedicine Group 等对 FimD、PilN 蛋白进行理化性质、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构、三级结构和B细胞表位预测,并进行综合分析,最终得出优势B细胞表位.结果显示,FimD、PilN蛋白都为亲水、稳定蛋白,无规则卷曲在二级结构中所占比例最高;FimD蛋白共有48个磷酸化位点,不存在跨膜区和信号肽;PilN蛋白共有85个磷酸化位点,PilN蛋白在1~50位氨基酸上可能出现跨膜区,26~27位氨基酸上出现信号肽;多种参数综合分析最终得到潜在的优势B细胞表位,FimD蛋白:7~18、144~152、307~315、365~373;PilN蛋白:77~86、138~149、516~524.通过对FimD、PilN蛋白进行综合分析,最终得出潜在的优势B细胞表位,为牛源致脑炎大肠杆菌多表位疫苗的进一步研究提供参考依据.
文献关键词:
牛源致脑炎大肠杆菌;FimD蛋白;PilN蛋白;生物信息学分析;B细胞抗原表位
作者姓名:
海永慧;钦倩;李蓓蓓;任静静;马勋;蒋建军;王鹏雁
作者机构:
石河子大学动物科技学院,新疆石河子832003
文献出处:
引用格式:
[1]海永慧;钦倩;李蓓蓓;任静静;马勋;蒋建军;王鹏雁-.牛源致脑炎大肠杆菌FimD、PilN蛋白的生物信息学分析和优势B细胞表位预测)[J].中国兽医杂志,2022(03):9-14,封2,封3
A类:
牛源致脑炎大肠杆菌,FimD,PilN,S9922,Immunomedicine
B类:
生物信息学分析,细胞表位,表位预测,ProtParam,TMHMM,NetPhos,DNASTAR,SOPMA,SWISS,MODEL,BepiPred,Group,信号肽,糖基化位点,磷酸化,二级结构,三级结构,亲水,无规则,卷曲,多表位疫苗,抗原表位
AB值:
0.186046
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。