典型文献
牦牛源C型产气荚膜梭菌动物致病性及其β毒素基因生物信息分析
文献摘要:
复苏培养本实验室保存的牦牛源C型产气荚膜梭菌Qinghai-06(GenBank登录号:MW980095),利用振荡比浊法、动物试验和病理切片方法对菌株生长曲线及动物致病性进行研究,随后通过对β毒素基因扩增、克隆、双向高通量测序、生物软件分析等分子生物学与生物信息学方法对其编码蛋白的一级结构、二级结构、三级结构、蛋白特殊区域及B细胞线性抗原表位进行分析.结果显示,牦牛源C型产气荚膜梭菌Qinghai-06菌株按照5%体积分数接种后,2~6 h为对数期;菌液D600nm值与稀释倍数的关系式为y=-0.857ln(x)+2.236;菌液D600nm值与菌落CFU的关系式为:y=0.881x-0.017;菌株对感染小鼠的LD50为0.408×108 CFU/mL.H.E染色镜检观察到可引起肠、脑、肾脏、肝脏、脾脏组织病理变化.β毒素基因序列长927 bp,共编码309个氨基酸,分子式为Ci535 H2396 N406 O502 S9,相对分子质量为34.9 ku,pI=5.52,不稳定指数为35.91,亲水性总平均值为-0.567,含有全部20种氨基酸,为单体,含1个Zn2+配体.结果表明:牦牛源C型产气荚膜梭菌Qinghai-06属强致病菌株,其β毒素蛋白为含丰富无规则卷曲结构和潜在磷酸化位点的、稳定的亲水性蛋白,有效B细胞线性抗原表位主要集中于140~290区段.
文献关键词:
牦牛;产气荚膜梭菌;病理切片;β毒素;生物信息分析
中图分类号:
作者姓名:
吴丹;黄家旗;罗润波;郭欣冉;吕家煌;宋仁德;索朗斯珠
作者机构:
西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000;江苏农业科学研究院兽医研究所,江苏南京210014;青海玉树藏族自治州畜牧兽医工作站,青海玉树815000
文献出处:
引用格式:
[1]吴丹;黄家旗;罗润波;郭欣冉;吕家煌;宋仁德;索朗斯珠-.牦牛源C型产气荚膜梭菌动物致病性及其β毒素基因生物信息分析)[J].中国兽医学报,2022(06):1184-1193
A类:
MW980095,D600nm,857ln,881x,Ci535,H2396,N406,O502
B类:
牦牛源,产气荚膜梭菌,致病性,毒素基因,生物信息分析,Qinghai,GenBank,登录号,比浊法,动物试验,病理切片,生长曲线,基因扩增,分子生物学,生物信息学方法,编码蛋白,二级结构,三级结构,抗原表位,菌液,倍数,关系式,+2,菌落,CFU,LD50,脾脏,病理变化,基因序列,bp,分子式,S9,相对分子质量,ku,pI,亲水性,Zn2+,致病菌,毒素蛋白,无规则,卷曲结构,磷酸化,区段
AB值:
0.262598
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。