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新城疫病毒Anhinga株HN基因的克隆与生物信息学分析
文献摘要：
克隆新城疫病毒中等毒力株Anhinga(Anh)的血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,用生物信息学软件分析其编码蛋白结构与功能的差异.根据已知的HN基因序列,通过Primer Premier 5.0设计引物,提取新城疫病毒总RNA,反转录成cDNA,PCR扩增HN基因,并将其连接到T载体上进行测序比对;用DNA-man、DNAstar、MEGA7.0及在线分析预测软件对HN基因编码的蛋白进行生物信息学分析.结果显示,HN基因全长为1 716 bp,与预期基因序列同源性达99.77％.其基本理化性质为亲水性跨膜蛋白,无信号肽序列,二级结构主要以无规则卷曲为主,属于神经氨酸酶CL21531超家族,三级结构与二级结构预测结果基本吻合,该蛋白存在多个潜在的B细胞表位.论文成功克隆并分析了HN基因所编码蛋白的主要特性及可能存在的抗原位点,为深入探究HN蛋白在NDV感染、增殖及抗肿瘤方面的作用奠定了基础.
文献关键词：
新城疫病毒;血凝素-神经氨酸酶蛋白;生物信息学;理化性质
中图分类号：
作者姓名：
何金娇;毛雪飞;仇书兴;李瑞;李鹏;董春秀;刘洋洋;栾淼;吴云舟
作者机构：
东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150030;新乡学院生命科学与基础医学学院,河南新乡453003
文献出处：
引用格式：
[1]何金娇;毛雪飞;仇书兴;李瑞;李鹏;董春秀;刘洋洋;栾淼;吴云舟-.新城疫病毒Anhinga株HN基因的克隆与生物信息学分析)[J].动物医学进展,2022(02):7-13
A类：
Anhinga,Anh,CL21531
B类：
新城疫病毒,HN,生物信息学分析,毒力,血凝素,神经氨酸酶,生物信息学软件,编码蛋白,蛋白结构,结构与功能,基因序列,Primer,Premier,引物,录成,cDNA,接到,man,DNAstar,MEGA7,在线分析,分析预测,预测软件,基因编码,全长,bp,序列同源性,基本理化性质,亲水性,跨膜蛋白,信号肽,肽序列,二级结构,无规则,卷曲,超家族,三级结构,结构预测,细胞表位,文成,主要特性,抗原位点,NDV
AB值：
0.356409
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