典型文献
棘球绦虫主要虫卵抗原蛋白分子特性的生物信息学分析
文献摘要：
目的 采用生物信息学软件分析棘球绦虫主要虫卵抗原(MEAs)蛋白的分子特性.方法 从NCBI蛋白质数据库中下载棘球绦虫MEAs蛋白的氨基酸序列,采用ProtParam、NetSolP-1.0、SignalP-5.0、TMHMM 2.0、ProtComp 9.0、Structure、NetPhos3.1、BCPREDS等在线分析程序预测理化性质、在大肠杆菌中的表达特性、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、保守结构域、磷酸化位点及B细胞表位,并通过MEGA 6.06程序对不同物种来源的MEAs蛋白构建进化树.结果 对11条棘球绦虫MEAs蛋白序列进行分析,序列长度为314～503 aa,等电点为5.73～7.26,分子量为35 843.76～54 356.24;在大肠杆菌中表达的可溶性为0.488 0～0.563 2,可用性为0.254 5～0.283 5;均具有典型的a晶体结构域,属于HSP20超家族;均含有丝氨酸磷酸化位点、苏氨酸磷酸化位点和酪氨酸磷酸化位点;均不存在信号肽序列及跨膜结构域,为非分泌、非跨膜蛋白;主要定位于胞质、胞核,在线粒体、胞外和质膜上也有分布;棘球绦虫MEAs蛋白优势B细胞抗原表位的数量为1～3.不同物种来源的MEAs蛋白分为两大枝,其中EmMEAp40_1、EgMEA_4、EgMEAp40_1与微小膜壳绦虫MEAp40等聚为一枝,其余8条棘球绦虫MEAs蛋白与日本血吸虫MEAs等聚为一枝.结论 通过生物信息学软件筛选了棘球绦虫MEAs蛋白的优势B细胞抗原表位,为进一步研究棘球绦虫MEAs蛋白的生物学功能提供参考.
文献关键词：
棘球绦虫;主要虫卵抗原;B细胞表位;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
李庆贺;张家耀;樊斌;王芬
作者机构：
恩施土家族苗族自治州中心医院,湖北恩施445000;遂宁市中心医院,四川 遂宁629000
文献出处：
引用格式：
[1]李庆贺;张家耀;樊斌;王芬-.棘球绦虫主要虫卵抗原蛋白分子特性的生物信息学分析)[J].中国热带医学,2022(07):611-616
A类：
主要虫卵抗原,NetSolP,BCPREDS,EmMEAp40,EgMEA,EgMEAp40,MEAp40
B类：
棘球绦虫,抗原蛋白,分子特性,生物信息学分析,生物信息学软件,MEAs,NCBI,蛋白质数据库,下载,氨基酸序列,ProtParam,SignalP,TMHMM,ProtComp,Structure,NetPhos3,在线分析,分析程序,大肠杆菌,表达特性,信号肽,跨膜结构域,亚细胞定位,保守结构域,细胞表位,MEGA,物种来源,进化树,aa,等电点,分子量,可用性,晶体结构,HSP20,超家族,丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸磷酸化,肽序列,非分,跨膜蛋白,质膜,抗原表位,大枝,小膜,膜壳,一枝,日本血吸虫,生物学功能
AB值：
0.300716
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