典型文献
鸭疫里默氏菌贵州分离株OmpA基因的克隆及生物信息学分析
文献摘要：
为了解鸭疫里默氏菌(Riemerellaanatipestifer,RA)贵州分离株OmpA基因遗传特性和用作基因工程亚单位疫苗开发的可能性,以13株RA贵州分离株(RA-SS-1～12株和RA-AS-1株)为研究对象,用RA OmpA基因特异性引物对13株RA贵州分离株进行PCR扩增,将扩增得到的OmpA基因片段与pMD19-T载体连接,转化大肠埃希氏菌DH5α感受态细胞,经PCR和双酶切鉴定为阳性克隆后进行测序;用生物信息学软件将13株RA贵州分离株与国内外15株参考株OmpA基因序列进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析,并对RA OmpA蛋白进行理化性质分析、跨膜结构和信号肽预测、B细胞抗原表位预测、二级和三级结构预测.结果表明,13株RA贵州分离株OmpA基因全长均为1164 bp,可编码387个氨基酸,株间核苷酸同源性为100％,与参考株GZ-RA8、GZ-RA9、GZ060302、SD-RA2018和Yb2株的同源性达100％";RA OmpA蛋白属亲水性蛋白,无跨膜和信号肽区域,含有较多的优势抗原表位结构,且OmpA基因高度保守并具有良好的抗原特性,其可作为制备RA基因工程亚单位疫苗的候选蛋白.
文献关键词：
鸭疫里默氏菌;OmpA基因;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
马光强;刘丽娟;陈国权;吴良涛;杨均;刘军泽;李潇蒙;潘成文;周碧君
作者机构：
黔南民族职业技术学院,贵州都匀 558000;都匀市农业农村局,贵州都匀 558000;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025
文献出处：
引用格式：
[1]马光强;刘丽娟;陈国权;吴良涛;杨均;刘军泽;李潇蒙;潘成文;周碧君-.鸭疫里默氏菌贵州分离株OmpA基因的克隆及生物信息学分析)[J].动物医学进展,2022(09):12-19
A类：
Riemerellaanatipestifer,RA8,RA9,GZ060302,RA2018
B类：
鸭疫里默氏菌,分离株,OmpA,生物信息学分析,基因遗传,遗传特性,基因工程,亚单位疫苗,疫苗开发,SS,AS,因特,特异性引物,pMD19,大肠埃希氏菌,DH5,感受态,双酶,生物信息学软件,基因序列,同源性分析,遗传进化分析,性质分析,膜结构,信号肽,抗原表位,表位预测,三级结构,结构预测,全长,bp,可编,Yb2,亲水性
AB值：
0.274507
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
