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典型文献
奶牛SP1基因结构及对乳脂合成功能的初步分析
文献摘要:
旨在探讨中国荷斯坦奶牛的特异性蛋白1(specificity protein,SP1)基因结构特征及其对奶牛乳脂合成的影响.根据NCBI已经公布的奶牛SP1基因序列(NM_001078027.1),利用生物信息学分析其序列保守性、理化性质、蛋白亲水性、蛋白质结构及互作蛋白;采用PCR技术扩增并克隆SP1基因CDS序列.然后,选取6头健康的中国荷斯坦奶牛,分别取泌乳期和干奶期奶牛乳腺组织,运用实时荧光定量PCR和Western blot方法检测SP1基因在不同时期奶牛乳腺组织中的表达情况.分离并纯化泌乳期奶牛乳腺上皮细胞,通过SP1过表达及干扰检测其对乳脂合成的影响,分别进行3次独立试验.结果显示,SP1基因序列在不同物种间高度保守,与山羊相似度最高(98.94%).奶牛SP1基因CDS区序列长2 361 bp,编码786个氨基酸,蛋白分子质量为80 902.17 u,理论等电点为6.94.平均疏水指数为-0.438,为不稳定的亲水性蛋白.SP1序列包含3个锌指结构,SP1蛋白二级结构以无规则卷曲(52.29%)为主.STRING蛋白互作分析结果显示,SP1与转录因子AP-l(JUN)、雌激素受体α(ERα)、MYC原癌基因蛋白(MYC)、TATA盒结合蛋白(TBP)等蛋白存在相互作用.实时荧光定量PCR和Western blot结果显示,SP1的mRNA和蛋白在泌乳期的表达量显著高于干奶期(P<0.01).在奶牛乳腺上皮细胞中过表达SP1显著增加细胞甘油三酯的合成(P<0.01),而干扰SP1的表达,甘油三酯合成显著降低(P<0.01).以上结果提示,SP1正向调控乳脂合成,分析SP1基因结构和功能为深入研究SP1对泌乳奶牛乳脂合成调控机制提供理论依据.
文献关键词:
中国荷斯坦奶牛;SP1基因;基因克隆;生物信息学;表达模式
作者姓名:
杨洋;周子薇;张京一;杨硕;王博宇;葛楠;林叶;侯晓明
作者机构:
东北农业大学细胞与遗传工程黑龙江省重点实验室,哈尔滨150030
文献出处:
引用格式:
[1]杨洋;周子薇;张京一;杨硕;王博宇;葛楠;林叶;侯晓明-.奶牛SP1基因结构及对乳脂合成功能的初步分析)[J].畜牧兽医学报,2022(09):2970-2981
A类:
B类:
SP1,基因结构,乳脂合成,初步分析,中国荷斯坦奶牛,specificity,protein,NCBI,基因序列,NM,利用生物,生物信息学分析,保守性,亲水性,蛋白质结构,互作蛋白,CDS,干奶期,乳腺组织,blot,泌乳期奶牛,奶牛乳腺上皮细胞,过表达,干扰检测,独立试验,种间,山羊,bp,分子质量,等电点,疏水,锌指,蛋白二级结构,无规则,卷曲,STRING,蛋白互作分析,AP,JUN,雌激素受体,ER,MYC,原癌基因蛋白,TATA,结合蛋白,TBP,加细,甘油三酯合成,结构和功能,泌乳奶牛,合成调控,调控机制,基因克隆,表达模式
AB值:
0.261946
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