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典型文献
硫氧还蛋白互作蛋白的生物信息学预测
文献摘要:
目的 分析硫氧还蛋白互作蛋白(thioredoxin-interacting protein,TXNIP)的氨基酸序列、结构特点、翻译后修饰及蛋白互作网络等生物学信息.方法 应用 ProtParam、ProtScale、SignalP 4.0 Server、SecretomeP 2.0 Server、TMHMM Server v.2.0、PSORTⅡ、DNAstar、NetNGlyc 1.0 Sever、STRING等多种生物信息学在线软件对TXNIP的理化性质、信号肽、跨膜结构、空间结构、翻译后修饰和蛋白互作网络等方面进行预测分析.结果 TXNIP为一种稳定亲水性蛋白,是非经典型分泌蛋白,不存在信号肽序列和跨膜区,β折叠是其二级结构的主要形式.TXNIP有14个O-糖基化位点,34个磷酸化位点.TXNIP与ITCH、NLRP3、TXN等10个蛋白有互作关系.结论 TXNIP不仅可诱导细胞凋亡,也是胰岛素抵抗及非酒精性脂肪肝病信号通路中的重要信号分子.本研究为进一步探索TXNIP在机体生命活动中的机制提供了实验依据.
文献关键词:
硫氧还蛋白互作蛋白;生物信息学;蛋白相互作用
作者姓名:
靳文文;李文龙;张志楠;焦向英
作者机构:
山西医科大学基础医学院生理学教研室,山西太原030001
引用格式:
[1]靳文文;李文龙;张志楠;焦向英-.硫氧还蛋白互作蛋白的生物信息学预测)[J].中国生物制品学杂志,2022(03):275-280
A类:
SecretomeP
B类:
硫氧还蛋白互作蛋白,thioredoxin,interacting,protein,TXNIP,氨基酸序列,翻译后修饰,蛋白互作网络,ProtParam,ProtScale,SignalP,Server,TMHMM,PSORT,DNAstar,NetNGlyc,Sever,STRING,信号肽,膜结构,预测分析,定亲,亲水性,非经典,经典型,分泌蛋白,肽序列,折叠,二级结构,主要形式,糖基化位点,磷酸化,ITCH,NLRP3,互作关系,胰岛素抵抗,非酒精性脂肪肝病,信号分子,生命活动,蛋白相互作用
AB值:
0.374045
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