典型文献
马氏珠母贝(Pinctada fucata)血细胞全长转录组测序与分析
文献摘要：
[目的]开发马氏珠母贝(Pinctada fucata)基因组资源,挖掘功能基因.[方法]以马氏珠母贝血细胞为试材,利用单分子实时技术(single?molecule real time,SMRT)进行全长转录组测序,并对所获得unigenes进行功能注释和基因结构分析.[结果]共获得277064条全长非嵌合序列和82381个基因.经过比对nr、SwissProt、KEGG和KOG数据库进行注释和功能分类后,共得到59621个注释基因.同时,在8493条基因中共发现11219个SSR位点,其中以二核苷酸重复基元类型最高(50.9％).生物信息学分析鉴定得到20013个ln?cRNA、2004个转录因子、10522个可变剪切分析位点.[结论]使用SMRT技术能够深入挖掘马氏珠母贝全长转录组数据,为进一步探讨马氏珠母贝功能基因的挖掘、免疫响应及遗传机制的研究提供可靠的基因组资源.
文献关键词：
马氏珠母贝;全长转录组;SSR标记;可变剪切
中图分类号：
作者姓名：
王菁;李桂英;陈志炜;郭焕娣;龚晓晴;王忠良
作者机构：
广东海洋大学水产学院,广东湛江524088
文献出处：
引用格式：
[1]王菁;李桂英;陈志炜;郭焕娣;龚晓晴;王忠良-.马氏珠母贝(Pinctada fucata)血细胞全长转录组测序与分析)[J].安徽农业科学,2022(06):86-90
A类：
B类：
马氏珠母贝,Pinctada,fucata,血细胞,全长转录组测序,功能基因,单分子,子实,single,molecule,real,SMRT,unigenes,功能注释,基因结构,共获,嵌合,nr,SwissProt,KOG,功能分类,注释基因,SSR,基元,生物信息学分析,分析鉴定,ln,cRNA,可变剪切,切分,转录组数据,免疫响应,遗传机制
AB值：
0.317349
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