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典型文献
盐胁迫下园林植物彩叶树响应菌根共生的比较转录组分析
文献摘要:
土壤盐分是典型的非生物胁迫因素之一,严重影响着植物的生长发育.为了解盐胁迫下鸡爪槭(Acer palmatum)对接种丛枝菌根真菌的应答分子机制,对接种丛枝菌根处理(AM)、盐胁迫处理(SS)、盐胁迫接种丛枝菌根处理(AS)及对照处理(CK)进行转录组测序分析.结果表明,基于转录组测序技术(RNA-Seq)测序共获得4672个新基因;将SS与AS处理进行比较时,鉴定出455个差异表达基因(DEGs),其中286个基因上调表达,169个基因下调表达.对获得的DEGs进行功能注释及富集分析,GO(gene ontology)分析结果表明,盐胁迫下接种丛枝菌根真菌涉及蛋白质生物合成相关过程、ATP生物合成过程、蛋白质谷胱甘肽化、细胞分化调控、氮同化相关过程、呼吸电子传递链以及类胡萝卜素代谢等生物过程.KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析结果表明,主要涉及苯丙烷、黄酮类、二芳基庚烷类及姜酚的次生代谢通路.综合GO、KE GG富集分析结果可知,这些基因主要参与植物细胞内部环境的改善、氮代谢相关过程和宿主光保护机制.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表明,挑选的6个DEGs表达趋势与测序结果高度一致,说明测序结果准确可靠.本研究丰富了丛枝菌根真菌对盐胁迫的改善机制,可为后续研究功能分析的耐盐候选基因提供理论依据.
文献关键词:
丛枝菌根真菌;彩叶树;鸡爪槭;差异基因(DEGs);盐胁迫;转录组
作者姓名:
陈盖;温可馨;司冰
作者机构:
唐山工业职业技术学院,河北唐山063299;渭南职业技术学院,陕西渭南714026
文献出处:
引用格式:
[1]陈盖;温可馨;司冰-.盐胁迫下园林植物彩叶树响应菌根共生的比较转录组分析)[J].江苏农业科学,2022(22):19-28
A类:
B类:
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AB值:
0.35274
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