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黄独微型块茎环阿屯醇合酶基因克隆与序列分析
文献摘要：
获取黄独皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶(CAS)的基因全长cDNA序列,并进行序列分析.通过黄独微型块茎转录组数据库筛选得到CAS基因的核心片段,利用RT-PCR技术获得CAS基因保守片段,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得CAS基因的3′及5′末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析.结果表明,黄独微型块茎CAS基因编码序列长2280 bp,编码814 bp的氨基酸序列,相对分子量为86665.17 u,等电点为6.21.CAS蛋白主要是由α螺旋(33.66％)、延伸链(21.62％)以及无规则卷曲(44.72％)构成.CAS蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,三级结构为单体,含有CAS所必需的功能结构域,具有PLN03012多元结构域.CAS蛋白主要存在于质膜和内质网,可能为膜蛋白.黄独CAS蛋白与其他植物的CAS蛋白同源性较高,其中与菊叶薯蓣的CAS蛋白氨基酸相似性为96.05％.从黄独微型块茎中首次获得CAS基因cDNA全长序列,该基因具有CAS同源基因的典型特征.
文献关键词：
黄独;微型块茎;环阿屯醇合酶;基因克隆;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
柯维忠;曾晓健;徐婷;刘霞霞;胡品书;游检
作者机构：
上饶师范学院生命科学学院,江西上饶334001;上饶农业技术创新研究院,江西上饶334001;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶市三叶青保育与利用技术创新中心,江西上饶334001
文献出处：
引用格式：
[1]柯维忠;曾晓健;徐婷;刘霞霞;胡品书;游检-.黄独微型块茎环阿屯醇合酶基因克隆与序列分析)[J].江苏农业科学,2022(04):29-35
A类：
微型块茎,环阿屯醇合酶,PLN03012
B类：
黄独,酶基因,基因克隆,序列分析,皂苷,合成途径,关键酶,CAS,全长,cDNA,转录组数据,选得,技术获得,RACE,生物信息学方法,基因编码,编码序列,bp,氨基酸序列,相对分子量,等电点,无规则,卷曲,亲水性,信号肽,三级结构,功能结构,结构域,多元结构,质膜,内质网,膜蛋白,同源性,菊叶薯蓣,同源基因,典型特征
AB值：
0.268818
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