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典型文献
三褶虾脊兰CtARF57和CtIAA12基因克隆及功能分析
文献摘要:
以三褶虾脊兰(Calanthe triplicata)不同发育时期的花瓣距为试材,基于转录组测序数据,通过克隆获得生长素信号转导途径中CtARF57和CtIAA12基因全长序列,并进行生物信息学分析,探究园林花卉三褶虾脊兰生长素相关响应因子(ARF和Aux/IAA)的表达特性及功能,以期揭示三褶虾脊兰花瓣距的发育机理.结果表明:cDNA全长为3054bp和1124bp,分别编码911、177个氨基酸.2个基因氨基酸序列与铁皮石斛同源基因的相似性较高,均超过84%.保守结构域分析表明CtARF57蛋白具有B3结构域、Auxin_resp结构域和Aux/IAA结构域;CtIAA12具有Aux/IAA蛋白的DomainⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ特异性结构域.实时荧光定量PCR结果显示,其转录水平受到生长素的诱导,不同时期基因表达水平差异明显,2个基因均在三褶虾脊兰花瓣距发育最后一个时期表达量最高,前2个时期表达量较低,与转录组FPKM值趋势一致.综上所述,初步推测2个响应因子基因参与生长素信号传导途径并调控园林花卉三褶虾脊兰花瓣距的形态建成和生长代谢过程.
文献关键词:
三褶虾脊兰;花瓣距;基因克隆;生长素信号
作者姓名:
万志庭;秦思;吴悠;陈伦妍;吴沙沙;翟俊文
作者机构:
福建农林大学 园林学院,兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室,福建 福州350002
文献出处:
引用格式:
[1]万志庭;秦思;吴悠;陈伦妍;吴沙沙;翟俊文-.三褶虾脊兰CtARF57和CtIAA12基因克隆及功能分析)[J].北方园艺,2022(09):80-87
A类:
三褶虾脊兰,CtARF57,CtIAA12,triplicata,花瓣距,Aux,3054bp,1124bp
B类:
基因克隆,功能分析,Calanthe,不同发育时期,转录组测序,序数,生长素信号转导,信号转导途径,基因全长序列,生物信息学分析,园林花卉,表达特性,兰花,cDNA,分别编,氨基酸序列,铁皮石斛,同源基因,保守结构域,B3,Auxin,resp,Domain,转录水平,基因表达水平,FPKM,综上所述,信号传导,传导途径,形态建成,生长代谢,代谢过程
AB值:
0.232986
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