典型文献
侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析
文献摘要：
[目的]分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础.[方法]对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化.[结果]获得4条CVX(CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS 和 CVX-ZYP)和5条 CVX-NTU(CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP)贵州火龙果分离物近全长基因组序列,长度为6 494～6 603 bp,覆盖参考基因组96.2％～99.6％;CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3％～98.6％,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1％～98.0％;CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1％～98.8％,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6％～99.1％;CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化.[结论]研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性,未发生明显遗传变异.
文献关键词：
仙人掌X病毒;宏转录组测序;遗传变异;序列一致性
中图分类号：
作者姓名：
郑乾明;柏自琴;王小柯;林乾;王彬;马玉华
作者机构：
贵州省果树科学研究所,贵州贵阳550006
文献出处：
引用格式：
[1]郑乾明;柏自琴;王小柯;林乾;王彬;马玉华-.侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析)[J].贵州农业科学,2022(04):1-7
A类：
Cactus,ZNS,ZYP
B类：
侵染,火龙果,仙人掌,病毒基因组,基因组序列,变异分析,virus,CVX,NTU,株系,遗传变异,分子检测,防控体系,感染病,宏转录组测序,生物信息学分析,系统进化,LW,RF,ZNF,分离物,近全长基因组,bp,参考基因,序列一致性,遗传分化,序列表
AB值：
0.177967
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