典型文献
杜梨叶片转录组分析
文献摘要：
杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)抗逆性强,叶色随季节变化而改变,被广泛用于沿海滩涂景观改造,是园林绿化中常用树种.为了解杜梨色叶相关基因调控途径,对杜梨叶片进行转录组测序,共获得67.7 Gb测序数据,通过组装共得到60 611个基因,其中包含1 059个新基因;与8个功能数据库进行比对分析,共57 669个基因得到了功能注释,注释效率为95.15％;GO分析发现,已注释的差异表达基因共涉及49个功能组,主要集中在膜(细胞组分)、催化活性(分子功能)、代谢过程(生物学过程)等中;KEGG分析发现,差异表达基因主要富集在碳代谢和植物-病原体相互作用等生物学过程中;共筛选出10个与类黄酮相关的基因,分别属于UDPGT等6个基因家族;在杜梨叶片转录组中共筛选出452 501个SNP位点,碱基转换类型所占比例远远高于颠换类型,表明杜梨具有丰富的SNP位点信息.本研究结果可为探究杜梨色叶分子机制等提供理论依据.
文献关键词：
杜梨;叶色;转录组测序;功能注释;单核苷酸多态性
中图分类号：
作者姓名：
陈燕;郭聪;王莹;李玉娟
作者机构：
江苏沿江地区农业科学研究所,江苏南通226541
文献出处：
引用格式：
[1]陈燕;郭聪;王莹;李玉娟-.杜梨叶片转录组分析)[J].江苏农业科学,2022(03):58-67
A类：
UDPGT
B类：
杜梨,叶片转录组,转录组分析,Pyrus,betulifolia,Bunge,抗逆性,叶色,季节变化,沿海滩涂,景观改造,园林绿化,树种,基因调控,调控途径,转录组测序,共获,Gb,序数,新基因,比对分析,功能注释,差异表达基因,功能组,催化活性,代谢过程,生物学过程,碳代谢,病原体,类黄酮,基因家族,SNP,碱基,位点信息,单核苷酸多态性
AB值：
0.373034
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