典型文献
一例Wiedemann-Steiner综合征患儿的
KMT2A移码变异分析
文献摘要:
目的:对1例Wiedemann-Steiner综合征(Wiedemann-Steiner syndrome, WDSTS)患儿的
KMT2A基因进行变异分析,明确其可能的致病原因,为临床诊断提供依据。
方法:提取患儿及双亲外周血DNA,应用一家三口全外显子基因组测序法(trio-whole exome sequencing, trio-WES)检测相关基因变异,通过Sanger测序法验证检出的变异。并对其进行生物信息学预测。结果:经trio-WES分析结果显示患儿
KMT2A基因第27外显子检出c.10488dupG (p.Leu3498Thrfs*41)杂合移码变异,该变异为未见报道过的新变异(noval);经Sanger测序验证患儿父母均未检出该变异,属于新发变异(
de novo)(PS2),且在主要人群基因频率数据库中均不存在(PM2)。c.10488dupG (p.Leu3498Thrfs*41)经MutationTaster变异预测软件预测,结果提示为有害变异(disease-causing);经HomoloGene系统分析
KMT2A基因编码的KMT2A是一类修饰与早期发育相关基因表达的重要组蛋白修饰酶,其第3498位Leu在哺乳动物至无脊椎动物之间均高度保守,它的改变会导致编码蛋白完整性受损,进而影响蛋白功能(PP3);进一步通过BLAST系统分析,c.10488dupG变异导致编码蛋白第3498位Leu变为Thr,导致编码蛋白在第3539位即提前终止编码,最终引起多个参与组蛋白修饰和识别的关键结构域丢失,生物学活性丧失(PVS1+PM1)。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,该变异判定为致病性变异(PVS1+PS2+PM1+PM2+PP3)。
结论:KMT2A基因c.10488dupG (p.Leu3498Thrfs*41)变异可能为该患儿罹患WDSTS的原因,
KMT2A新致病变异的检出丰富了
KMT2A基因的变异谱。
文献关键词:
KMT2A基因
;Wiedemann-Steiner综合征;新发变异;移码变异
中图分类号:
作者姓名:
吴若豪;唐文婷;邱坤银;张旭;孟哲
作者机构:
中山大学孙逸仙纪念医院儿科,广州 510120;中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广州 510060
文献出处:
引用格式:
[1]吴若豪;唐文婷;邱坤银;张旭;孟哲-.一例Wiedemann-Steiner综合征患儿的
KMT2A移码变异分析
)[J].中华医学遗传学杂志,2022(06):630-633
A类:
WDSTS,10488dupG,Leu3498Thrfs,noval,HomoloGene,PVS1+PM1,PVS1+PS2+PM1+PM2+PP3
B类:
一例,Wiedemann,Steiner,KMT2A,移码变异,变异分析,syndrome,致病原因,双亲,三口,外显子,基因组测序,trio,whole,exome,sequencing,WES,基因变异,Sanger,杂合,见报,新变异,患儿父母,未检,新发变异,novo,基因频率,MutationTaster,预测软件,软件预测,disease,causing,基因编码,早期发育,相关基因表达,组蛋白修饰酶,哺乳动物,无脊椎动物,编码蛋白,蛋白功能,BLAST,提前终止,结构域,生物学活性,医学遗传学,基因组学,遗传变异,分类标准,致病性变异,罹患,致病变异
AB值:
0.290437
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