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青岛市急性呼吸道感染儿童中人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶基因特征分析
文献摘要：
探讨山东省青岛市地区急性呼吸道感染患儿人副流感病毒3型（HPIV-3）的感染情况，并分析HPIV-3血凝素-神经氨酸酶蛋白（HN）基因特征。本研究为横断面研究，青岛市妇女儿童医院、青岛大学附属医院西海岸院区及崂山院区在2018年1月至2019 年12月期间，每月随机采集急性呼吸道感染（ARTI）儿科患者的咽拭子样本，总共1 674份，采用多重实时荧光逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法，筛查HPIV-3阳性样本。采用巢式PCR方法扩增HPIV-3阳性样本HN全长基因并进行序列测定，序列结果与GenBank中HPIV-3的代表株进行对比分析，建立系统进化树。结果显示，1 674份咽拭子样本中，HPIV-3阳性有90份，检出率为5.37%，其中，6岁以下儿童占97.78%（88份）。HPIV-3阳性病例主要分布在春季和夏季。通过巢式PCR方法扩增得到44株HPIV-3 HN基因全长序列，序列比对及进化分析表明，HPIV-3 HN基因属于C3基因亚型的C3a和C3b分支，其中，C3a亚型有30株，C3b亚型有14株。44株青岛分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0%~100.0%和98.5%~100.0%。综上，2018至2019年间，HPIV-3 C3基因型的C3a和C3b分支在山东省青岛市地区循环流行，其HN基因型变异较小，进化上具有一定的地域特征。
文献关键词：
副流感病毒3型，人;呼吸道感染;血凝素-神经氨酸酶蛋白;系统进化分析
中图分类号：
作者姓名：
郝康宇;刘子然;宫金伶;孙睿;张凤;王文静;高嘉禾;汪照国
作者机构：
青岛大学公共卫生学院流行病学与卫生统计系，青岛 266071;青岛市疾病预防控制中心，青岛市预防医学研究院，青岛 266033;山东省青岛第二中学，青岛 266061
文献出处：
引用格式：
[1]郝康宇;刘子然;宫金伶;孙睿;张凤;王文静;高嘉禾;汪照国-.青岛市急性呼吸道感染儿童中人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶基因特征分析)[J].中华预防医学杂志,2022(05):626-631
A类：
ARTI
B类：
急性呼吸道感染,人副流感病毒,血凝素,神经氨酸酶,酶基因,基因特征分析,山东省青岛市,染患,HPIV,感染情况,HN,横断面研究,妇女儿童医院,青岛大学,大学附属医院,西海岸,院区,崂山,每月,随机采集,儿科患者,咽拭子,子样本,总共,逆转录,聚合酶链反应,阳性样本,序列测定,GenBank,代表株,建立系统,系统进化树,阳性病例,基因全长序列,序列比对,基因亚型,C3a,C3b,分离株,同源性,循环流,基因型变异,地域特征,系统进化分析
AB值：
0.265527
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