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2001—2018年上海市麻疹病毒流行株血凝素基因特征分析
文献摘要：
[目的]分析2001—2018年上海市麻疹病毒(MeV)流行株血凝素(H)基因特征.[方法]收集2001—2018年上海市报告疑似麻疹病例的咽拭子样本,采用非洲绿猴肾细胞(Vero)/转染人信号淋巴细胞激活因子(hSLAM)细胞分离MeV,提取病毒核酸,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增H基因全长,对扩增后的产物进行测序及序列分析,分析其基因特征.[结果]2001—2018年上海市麻疹风疹监测网络共收集咽拭子样本5665份,分离到1394株MeV,349株代表性MeV分离株H基因核苷酸和氨基酸同源性分别为87.4％～100.0％和85.1％～100.0％;与中国疫苗株(S191)核苷酸和氨基酸同源性为85.7％～100.0％和84.1％～100.0％.所有H1a基因亚型MeV分离株均丢失aa240所在的糖基化位点.[结论]2001—2018年上海市MeV流行株根据H基因进行的分子分型结果与N基因C末端450片段分子分型结果一致,绝大多数为H1a基因亚型,H蛋白氨基酸序列在主要功能位点上是比较保守的.
文献关键词：
麻疹病毒;血凝素;亲缘性分析;氨基酸变异
中图分类号：
作者姓名：
杨玉颖;陈达瑜;唐伟;李云逸;王嘉瑜;李淑佩;李崇山
作者机构：
上海市疾病预防控制中心,上海 200336;上海交通大学医学院,上海 200025;上海重大传染病和生物安全研究院,上海 200032
文献出处：
引用格式：
[1]杨玉颖;陈达瑜;唐伟;李云逸;王嘉瑜;李淑佩;李崇山-.2001—2018年上海市麻疹病毒流行株血凝素基因特征分析)[J].上海预防医学,2022(05):436-440
A类：
hSLAM,S191,aa240,亲缘性分析
B类：
麻疹病毒,血凝素,基因特征分析,MeV,市报,咽拭子,子样本,肾细胞,Vero,转染,细胞激活,细胞分离,病毒核酸,逆转录聚合酶链反应,全长,序列分析,风疹,监测网络,共收,分离株,同源性,疫苗株,H1a,基因亚型,糖基化位点,分子分型,氨基酸序列,主要功能,氨基酸变异
AB值：
0.263903
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