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2020年安徽省手足口病柯萨奇病毒A10型病原特征分析
文献摘要:
目的:了解安徽省2020年柯萨奇A组10型(coxsackievirus A10,CV-A10)流行特征及VP1区基因特征。方法:选取2020年1月至12月安徽省各市疾控中心上送的手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)标本,接种人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离培养,采用荧光定量RT-PCR鉴定病毒分离物,对CV-A10毒株进行RT-PCR VP1区扩增及序列测定,使用软件对测序结果进行分析并构建系统进化树。结果:共分离HFMD标本186份,阳性标本147株,其中CV-A10分离株13株,占8.84%(13/147),柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分离株4株,占2.72%(4/147),柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)分离株130株,占88.44%(130/147),未分离到肠道病毒A组71型(enterovirusA71,EV-A71),总病毒分离率为79.03%。将13株CV-A10毒株进行VP1区全长扩增,共获得6条完整VP1序列。本研究中CV-A10毒株VP1区核苷酸同源性为97.9%~100.0%,氨基酸同源性为99.0%~100.0%;与CV-A10原型株(Kowalik)VP1区核苷酸同源性为76.3%~76.6%,氨基酸同源性为92.3%~100.0%。系统进化分析显示CV-A10可划分为分为A~I 9个基因型,2020年安徽省6株CV-A10均属于C基因型。结论:2020年安徽省CV-A10毒株属于C基因型,为优势流行基因型,与国内其他地区毒株共进化。
文献关键词:
手足口病;柯萨奇病毒A组10型;基因特征;进化分析
中图分类号:
作者姓名:
葛盈露;傅荔艳;王鹏;马婉婉;孙永;史永林
作者机构:
安徽省疾病预防控制中心 安徽省医疗卫生重点专科病原微生物分子生物学实验室,合肥 230601;安徽医科大学公共卫生学院,合肥 230032
文献出处:
引用格式:
[1]葛盈露;傅荔艳;王鹏;马婉婉;孙永;史永林-.2020年安徽省手足口病柯萨奇病毒A10型病原特征分析)[J].国际病毒学杂志,2022(05):400-403
A类:
enterovirusA71,Kowalik
B类:
手足口病,柯萨奇病毒,A10,病原特征,coxsackievirus,CV,流行特征,VP1,基因特征,各市,疾控中心,心上,上送,hand,foot,mouth,disease,HFMD,横纹肌肉瘤,病毒分离,分离培养,分离物,毒株,序列测定,建系,系统进化树,阳性标本,分离株,A16,A6,未分离,肠道病毒,EV,分离率,全长,共获,同源性,系统进化分析,优势流,流行基因型
AB值:
0.295366
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