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深圳市啮齿动物感染汉坦病毒的基因特征研究
文献摘要：
目的:研究深圳市啮齿动物所携带的汉坦病毒分子流行病学特征，分析汉坦病毒基因型别。方法:采用笼日法布点捕鼠，收集鼠肺标本后研磨提取RNA。运用实时荧光PCR方法进行分型检测，进一步采用反转录-巢式PCR扩增部分M片段G2区和S片段核苷酸序列，并进行同源性和系统进化树分析。结果:共捕获200只鼠类动物，包含褐家鼠189只、黄胸鼠9只和小家鼠2只。汉坦病毒检出率为21.0%（42/200），均为汉城病毒，其中宝安区鼠肺检出率最高，达45.7%（
χ2=25.60，
P<0.05）。从阳性鼠肺标本中分别扩增出25条汉坦病毒M片段G2区和S片段序列，核苷酸同源性分别为95.3%~100.0%和97.6%~100.0%，与来自广州市的参考序列核苷酸相似性较高。系统进化树显示此次研究深圳市鼠类动物所携带的汉坦病毒均为汉城病毒的S2亚型。氨基酸突变位点分析发现，在S基因编码的核衣壳蛋白中存在1个位点突变，为BA-111第973位由丙氨酸（Ala）变为苏氨酸（Thr）。
结论:深圳市鼠类动物所携带的汉坦病毒为汉城病毒的S2亚型，与深圳市历年以及周边省市汉坦病毒代表病毒毒株相比变异不大。
文献关键词：
汉坦病毒;汉城病毒;基因分型;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
罗瑶;李玥;黄亚兰;张晓敏;熊玲红;张仁利;阳帆
作者机构：
南方医科大学公共卫生学院，广州 510515;深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所，深圳 518055
文献出处：
引用格式：
[1]罗瑶;李玥;黄亚兰;张晓敏;熊玲红;张仁利;阳帆-.深圳市啮齿动物感染汉坦病毒的基因特征研究)[J].中华流行病学杂志,2022(11):1804-1810
A类：
B类：
啮齿动物,物感,汉坦病毒,基因特征,动物所,分子流行病学,流行病学特征,病毒基因,基因型别,布点,捕鼠,研磨,分型检测,G2,行同,同源性,系统进化树分析,鼠类动物,褐家鼠,黄胸鼠,小家鼠,汉城病毒,宝安区,段序列,参考序列,S2,氨基酸突变,突变位点,基因编码,核衣壳蛋白,个位,位点突变,BA,丙氨酸,Ala,苏氨酸,Thr,历年,病毒毒株,基因分型,序列分析
AB值：
0.306967
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