目的:基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase，HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3, HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法:采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查，对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定，与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对，应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果:本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列，核苷酸同源性在96.6%~100%之间，其中48株为C3基因亚型，1株为C5基因亚型。系统进化分析显示，我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行，毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%，其中C3是我国的优势流行基因亚型，分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支，以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示，其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年，有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳；C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10 -4~5.82×10 -4替换/位点/年之间；C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点，选择压力以负向选择为主。 结论:C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别，形成了广泛传播和持续流行态势，并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

人副流感病毒3型;血凝素-神经氨酸酶蛋白;基因特征;贝叶斯进化分析

江洁;赵林清;穆敏;王文洋;徐瑾;蔡亮;谢正德;朱贞;张燕;周杉杉;冯意;毛乃颖

国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室　世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室　中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室，北京　102206;首都儿科研究所病毒研究室，北京　100020;安徽理工大学医学院免疫学教研室，淮南　232001;河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所，郑州　450016;湖南省疾病预防控制中心微生物检验科，长沙　410005;首都医科大学附属北京儿童医院　北京市儿科研究所感染与病毒研究室，北京　100045

中华实验和临床病毒学杂志

[1]江洁;赵林清;穆敏;王文洋;徐瑾;蔡亮;谢正德;朱贞;张燕;周杉杉;冯意;毛乃颖-.我国人副流感病毒3型HN基因的遗传变异及进化特征分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(02):141-149

HPIV3,C3e,C3f,tMRCA,N308,N351,N485,N523

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