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2016—2019年深圳市盐田区甲型H1N1流感病毒NA基因特征研究
文献摘要:
目的:分析深圳市盐田区2016—2019监测年度甲型H1N1流感病毒NA基因特征。方法:选取35株盐田区分离的甲型H1N1流感病毒毒株进行NA基因序列分析、进化分析、抗原决定簇位点、耐药位点和糖基化改变的变异分析。结果:进化树分析表明,本研究所分析毒株分布在6B分支,2016年上半年毒株分布在6B.2簇;2016年下半年及2017年度毒株分布在6B.1簇;2018—2019年度毒株分布在6B.1A簇。2016年核苷酸同源性为97.87%~98.09%,氨基酸同源性为96.85%~96.89%,2016年毒株与同年度疫苗株位于不同分支,同源性较低。2017年核苷酸同源性为98.62%~99.35%,氨基酸同源性为99.57%~99.78%;2018年核苷酸同源性为99.35%~99.86%,氨基酸同源性为99.05%~99.12%;2019年核苷酸同源性为99.20%~99.86%,氨基酸同源性为99.19%~99.78%。2017—2019年毒株与当年度疫苗株位于同一分支,同源性较高。与各年度疫苗株相比,盐田区流感毒株NA蛋白存在29个氨基酸位点变异。抗原决定簇区域:与疫苗株A/California/7/2009相比,所有毒株都存在N200S、I365T和K432E变异,与A/Michigan/45/2015和A/Brisbane/02/2018相比,2018年和2019年有9株存在I365T变异。所有毒株没有发现催化部位及周围辅助部位、NA耐药相关基因位点发生变异。3株发生42NQS糖基化位点缺失,4株发生50NQS位点转变为50NKS。结论:盐田区甲型H1N1流感病毒NA基因及其氨基酸持续变异,应加强流感病毒监测,为科学防控提供依据。
文献关键词:
A(H1N1)pdm09流感;神经氨酸酶;NA基因
中图分类号:
作者姓名:
崔栋;肖娜;顾嘉颖;钟冠南;杨晓华;洪文腾;曾凡竹
作者机构:
深圳市盐田区疾病预防控制中心检验科 518081
文献出处:
引用格式:
[1]崔栋;肖娜;顾嘉颖;钟冠南;杨晓华;洪文腾;曾凡竹-.2016—2019年深圳市盐田区甲型H1N1流感病毒NA基因特征研究)[J].国际病毒学杂志,2022(05):420-425
A类:
N200S,I365T,K432E,催化部位,42NQS,50NQS,50NKS
B类:
盐田区,甲型,H1N1,流感病毒,NA,基因特征,病毒毒株,基因序列分析,进化分析,抗原决定簇,变异分析,进化树分析,所分,6B,上半年,下半年,1A,同源性,疫苗株,当年度,各年,氨基酸位点,点变异,California,有毒,Michigan,Brisbane,有发现,基因位点,糖基化位点,科学防控,pdm09,神经氨酸酶
AB值:
0.218885
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