典型文献
2019年福建省汉坦病毒分离株全基因组序列测定及分析
文献摘要：
目的 从分子水平分析2018-2020年福建省汉坦病毒(HV)分离株的型别,为疾病的预防控制提供实验依据.方法 采集2018-2020年福建省肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本.采用胶体金法检测血清样本中HV的IgM、IgG抗体,采用免疫荧光法检测鼠肺样本中HV抗原,阳性样本接种E6细胞分离病毒,用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测标本培养物上清,免疫荧光检测培养细胞以鉴定HV.采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA 11.0软件对其进行序列比对和进化分析.结果 捕获鼠形动物879只,阳性率为2.84％.分离得到2株病毒,均来自黑线姬鼠.基因组序列分析显示为汉滩病毒(HTNV).采用最大似然法构建系统发育树中,所分离病毒株形成独立支系,与LongquanAa-10-101、Z251、LongquanMf-08-92等浙江地区HV分离株基因组核苷酸序列一致性较高,约为95.81％,聚集形成一个分支.氨基酸序列比对分析显示,所分离株与疫苗株Z10核蛋白相比,存在Thr43Ala、Lys95Met突变;与HTNV国际标准株76-118和疫苗株84FLi相比,缺少一个第N766位的糖基化位点.结论 本研究提示福建地区流行HV具有独特基因特征,与浙江地区HV分离株具有较近的亲缘关系,可能源自共同进化的祖先,所分离病毒包膜糖蛋白和核衣壳蛋白的氨基酸变异所造成的影响,值得进一步关注和研究.
文献关键词：
肾综合征出血热;汉坦病毒;基因组;序列测定;系统发育树
中图分类号：
作者姓名：
刘菁;陈阳;韩腾伟;刘维俊;曾志伟;林文;王加熊;林代华;肖方震
作者机构：
福建省疾病预防控制中心,福建省人兽共患病研究重点实验室,福建福州350012
文献出处：
引用格式：
[1]刘菁;陈阳;韩腾伟;刘维俊;曾志伟;林文;王加熊;林代华;肖方震-.2019年福建省汉坦病毒分离株全基因组序列测定及分析)[J].疾病监测,2022(09):1165-1169
A类：
LongquanAa,Z251,LongquanMf,Thr43Ala,Lys95Met,84FLi,N766
B类：
汉坦病毒,病毒分离,分离株,全基因组序列,序列测定,分子水平,水平分析,HV,型别,预防控制,肾综合征出血热,HFRS,急性期,监测点,胶体金法,血清样本,IgM,IgG,免疫荧光法,阳性样本,E6,细胞分离,反转录聚合酶链式反应,上清,免疫荧光检测,高通量测序技术,全基因组测序,MEGA,进化分析,鼠形动物,黑线姬鼠,基因组序列分析,汉滩病毒,HTNV,最大似然法,建系,系统发育树,所分,毒株,支系,浙江地区,序列一致性,氨基酸序列比对,比对分析,疫苗株,Z10,核蛋白,白相,国际标准,标准株,糖基化位点,福建地区,基因特征,亲缘关系,共同进化,祖先,包膜,膜糖蛋白,核衣壳蛋白,氨基酸变异
AB值：
0.355209
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