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2017—2019年河南省漯河市严重急性呼吸道感染病例人腺病毒基因特征分析
文献摘要:
目的:了解我国河南省漯河市严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)病例人腺病毒(human adenovirus,HAdV)基因特征。方法:对2017年10月至2019年2月SARI病例中鉴定的HAdV阳性标本进行病毒分离后,扩增并测定其Hexon基因的Loop2区域,初步鉴定病毒分离株型别。然后根据初筛结果,分别使用HAdV各型特异性引物扩增病毒株3个靶基因(Penton base、Hexon和Fiber)的序列全长,并与各型原型株以及国内外相应型别代表株进行系统发育和序列同源性分析,以确定HAdV病毒株型别并了解其基因特征。结果:从河南省漯河市783份SARI病例中鉴定的27份HAdV阳性咽拭子标本中,共分离获得18株病毒分离株,分子分型结果显示,这些毒株分属于B亚属(HAdV-3、HAdV-7和HAdV-55)、C亚属(HAdV-1、P1H2F2、Px1/Ps3H5F5、P89H5F5和HAdV-6)和E亚属(HAdV-4)。其中C亚属HAdV-1分离阳性率最高(33.3%),其次为B亚属HAdV-3(22.2%)和C亚属P1H2F2(11.1%)。本研究4种HAdV病毒株(HAdV-3、HAdV-4、HAdV-7和HAdV-55)基因组序列在时间和空间上具有显著的保守性和稳定性特点,而HAdV-C鉴定了3种基因重组模式(P1H2F2、Px1/Ps3H5F5和P89H5F5),其潜在的公共卫生意义需进一步研究证实。结论:2017—2019年河南省漯河市SARI病例HAdV感染主要以C亚属为主,其次为B亚属和E亚属,该数据为当地腺病毒相关传染病的预防控制提供了科学依据。
文献关键词:
严重急性呼吸道感染;人腺病毒;基因分型;基因特征
中图分类号:
作者姓名:
蔡建林;徐瑾;赵升;张智博;刘莹;冯意;江洁;崔爱利;张燕;许文波;朱贞;毛乃颖
作者机构:
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,北京 102206;河南省疾病预防控制中心,郑州 450016;漯河市疾病预防控制中心,漯河 462000
文献出处:
引用格式:
[1]蔡建林;徐瑾;赵升;张智博;刘莹;冯意;江洁;崔爱利;张燕;许文波;朱贞;毛乃颖-.2017—2019年河南省漯河市严重急性呼吸道感染病例人腺病毒基因特征分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(04):385-396
A类:
Loop2,Penton,P1H2F2,Px1,Ps3H5F5,P89H5F5
B类:
漯河市,严重急性呼吸道感染,感染病,人腺病毒,病毒基因,基因特征分析,severe,acute,respiratory,infection,SARI,human,adenovirus,HAdV,阳性标本,病毒分离,Hexon,分离株,株型,型别,初筛,各型,特异性引物扩增,毒株,靶基因,base,Fiber,全长,代表株,系统发育,序列同源性,同源性分析,咽拭子,分子分型,分属,基因组序列,保守性,基因重组,重组模式,生意,预防控制,基因分型
AB值:
0.245257
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