典型文献
进行性肌阵挛共济失调近亲家系全外显子测序漏诊原因分析与对策
文献摘要：
目的:分析近亲家系全外显子测序(whole exome sequencing,WES)中漏诊5例进行性肌阵挛共济失调(progressive myoclonic ataxia,PMA)患者的原因,并探讨对策.方法:收集5例WES未发现致病突变而临床拟诊为PMA患者,对其近亲婚配家系(三代以内旁系血亲婚配)进行全基因组SNP芯片扫描,通过纯合子定位技术及单倍型分析定位致病区间,结合患者的肌阵挛和共济失调表型,明确其可能的致病基因.采用Sanger测序对候选的突变位点进行家系共分离分析,最后通过溯源WES比对过程中的SAM与BAM文件,分析WES漏诊的原因.结果:纯合区间定位和重分析WES发现,5例PMA家系为NEU1基因c.544A>G(p.S182G)纯合突变导致的Ⅰ型唾液酸沉积症(sialidosis typeⅠ,ST-Ⅰ).人类基因组参考序列中的ALT contig在WES比对过程中可造成包括NEU1基因在内的多个PMA致病基因检出遗漏.结论:临床诊断中,常染色体隐性遗传的PMA需关注NEU1基因突变所导致的ST-Ⅰ.对于WES未发现致病位点的PMA家系,可结合家系遗传方式、全基因组SNP芯片等方法定位致病区间,再结合患者的临床表型以明确其疾病致病基因.
文献关键词：
进行性肌阵挛共济失调;Ⅰ型唾液酸沉积症;全外显子测序;NEU1基因
中图分类号：
作者姓名：
杨慧;李云璐;杨康;李世举;何瑾
作者机构：
福建中医药大学附属第二人民医院神经内科,福建 福州 350003;福建医科大学附属第一医院神经内科,福建 福州 350005
文献出处：
引用格式：
[1]杨慧;李云璐;杨康;李世举;何瑾-.进行性肌阵挛共济失调近亲家系全外显子测序漏诊原因分析与对策)[J].诊断学理论与实践,2022(04):456-461
A类：
进行性肌阵挛共济失调,myoclonic,旁系血亲,544A,S182G,唾液酸沉积症,sialidosis
B类：
调近,亲家,全外显子测序,漏诊,分析与对策,whole,exome,sequencing,WES,progressive,ataxia,PMA,致病突变,近亲婚配,全基因组,SNP,纯合子,定位技术,单倍型分析,病区,致病基因,Sanger,突变位点,行家,分离分析,SAM,BAM,NEU1,纯合突变,type,ST,人类基因,参考序列,ALT,contig,遗漏,常染色体隐性遗传,基因突变,病位,合家,家系遗传,遗传方式,临床表型
AB值：
0.261739
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