目的 应用在线软件分析布鲁菌丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO1抗原蛋白的生物学信息,为研制布鲁菌病基因疫苗奠定基础.方法 采用蛋白质分析系统Protparam()分析布鲁菌丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO 1蛋白的理化性质;利用软件Protscale()蛋白质在线分析RIO 1蛋白的脂肪指数、亲(疏)水性;利用 SOMPA 在线分析软件()获得蛋白质二级结构包括α螺旋、延伸链、β折叠、无规则卷曲卷曲的分布和比例;利用Py MOL viewer软件作图构建三级结构模型.结果 氨基酸序列Leu(L)占13.6％,Glu(E)占10.2％,Gly(G)占8.8％.RIO1蛋白正电荷残基(Arg+Lys)和负电荷残基(Asp+Glu)总数分别为8和为24,不稳定指数24.11,分析为不稳定的亲水蛋白.α螺旋(Hh)占44.22％(65个);无规则卷曲(Cc)占34.02％(50个),延伸链(Ee)占18.37％(27个).β折叠主要位于21～23、30～32、42～44、70～72和122～126;无规卷曲结构主要位于18～22、27～29、32～35、72～76、83～85和92～94.RIO1蛋白含有糖基化位点,并存在可能的酸磷酸化位点.结论 布鲁菌丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO1 α螺旋及无规卷曲结构较多,易与配体发生结合产生抗原表位,免疫原性良好,可为布鲁菌多价表位疫苗的研发提供参考.

布鲁菌;RIC1蛋白;抗原表位;生物信息学

王艳;张东军;张国清

山东省寄生虫病防治研究所,山东第一医科大学(山东省医学科学院),山东第一医科大学附属消化病医院,山东济宁272033;济宁市疾病预防控制中心,山东济宁272000

寄生虫病与感染性疾病

[1]王艳;张东军;张国清-.布鲁菌丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO1的生物信息学分析)[J].寄生虫病与感染性疾病,2022(03):159-165

RIO1,SOMPA,RIC1

菌丝,丝氨酸,苏氨酸,蛋白激酶,生物信息学分析,抗原蛋白,布鲁菌病,基因疫苗,Protparam,利用软件,Protscale,在线分析,脂肪指数,蛋白质二级结构,折叠,无规则,Py,MOL,viewer,作图,三级结构,氨基酸序列,Leu,Gly,正电荷,残基,Arg+Lys,负电荷,Asp+Glu,亲水,Hh,Cc,Ee,卷曲结构,糖基化位点,磷酸化,抗原表位,免疫原性,多价,表位疫苗

0.3321