典型文献
全基因组水平紫花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下表达模式分析
文献摘要：
紫花苜蓿是世界最重要的豆科牧草之一,干旱是影响其产量和地理分布的关键瓶颈.在紫花苜蓿响应干旱胁迫过程中,转录因子发挥着重要的调控作用.TCP(teosinte branchesd 1/cycloidea/pro-liferating cell factors)为植物特有的转录因子,在植物生长、发育、响应逆境胁迫中都具有重要的生物学功能.截至目前,该基因家族在紫花苜蓿中的分布以及响应干旱胁迫的生物学功能仍未见报道.因此,为进一步挖掘紫花苜蓿中响应干旱胁迫功能基因,本研究利用生物信息学方法在全基因组水平对TCP基因家族进行了鉴定,并对其系统进化、基因结构、染色体定位、共线性分析以及干旱胁迫下的表达模式进行了分析.结果表明,紫花苜蓿基因组中共鉴定出40个MsTCP基因,不均匀地分布于20条染色体上,其中包括17对旁系同源基因对,且都是基因片段复制事件.系统发育和保守结构域分析发现,MsTCP基因可以分为2个大分支和3个亚家族(PCF,CIN与CYC/TB1),同一分支中的成员具有相同氨基酸数目的TCP结构域,同亚家族中的成员具有相似的保守基序与基因结构.此外,通过分析紫花苜蓿响应干旱转录组数据共鉴定出4个可能与紫花苜蓿响应干旱胁迫有关的MsTCP基因(MsTCP23,MsTCP27,MsTCP29,MsTCP33).qRT-PCR结果进一步表明PEG模拟干旱胁迫处理后,这4个基因的表达量在根和叶中均显著上调,进一步确定了这些基因的确响应紫花苜蓿干旱胁迫.该研究为后期深入解析紫花苜蓿响应干旱胁迫理论以及通过基因工程技术创制高抗旱紫花苜蓿新种质奠定基础.
文献关键词：
紫花苜蓿;系统发育分析;干旱胁迫;基因表达分析
中图分类号：
作者姓名：
魏娜;李艳鹏;马艺桐;刘文献
作者机构：
兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室,兰州大学草地农业教育部工程研究中心,兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020
文献出处：
引用格式：
[1]魏娜;李艳鹏;马艺桐;刘文献-.全基因组水平紫花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下表达模式分析)[J].草业学报,2022(01):118-130
A类：
branchesd,liferating,MsTCP,MsTCP23,MsTCP27,MsTCP29,MsTCP33
B类：
全基因组,紫花苜蓿,基因家族,干旱胁迫,表达模式分析,豆科牧草,地理分布,关键瓶颈,teosinte,cycloidea,pro,cell,factors,植物生长,逆境胁迫,生物学功能,见报,功能基因,研究利用,利用生物,生物信息学方法,系统进化,基因结构,染色体定位,共线性分析,旁系,同源基因,保守结构域,亚家族,PCF,CIN,CYC,TB1,保守基序,转录组数据,qRT,PEG,胁迫处理,基因工程技术,创制,高抗,抗旱,新种质,系统发育分析,基因表达分析
AB值：
0.240148
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