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狗尾草GASA基因家族鉴定及其在不同逆境下表达模式分析
文献摘要：
GASA蛋白(Gibberellic acid-stimulated in arabidopsis)是植物特有的小分子蛋白,通过参与调控相关植物激素信号转导与生长发育过程在植物体内发挥着重要作用.深入研究GASA蛋白的功能对阐明植物小分子蛋白作用机理具有重要理论研究意义.狗尾草(Setaria viridis)是新型的C4模式植物,对其GASA基因家族的研究尚未见报道.本研究采用生物信息学技术,基于狗尾草全基因组序列,分析获得12个GASA基因.进一步生物信息学分析结果表明,狗尾草GASA家族基因结构简单,GASA蛋白可划分为三个进化枝,均含有3～4个模体结构,12个基因启动子区共同含有响应脱水、低温、高盐及植物激素的顺式作用元件.采用实时荧光定量PCR技术对短期干旱(15％聚乙二醇6000)、冷害(4℃)、盐害(150 mM NaCl)逆境胁迫下狗尾草叶片中GASA基因表达模式进行了初步研究.结果表明,狗尾草不同GASA基因对各类逆境胁迫有响应.研究结果将为进一步开展GASA基因参与逆境胁迫的功能解析提供初步的实验证据.
文献关键词：
GASA蛋白;生物信息学分析;逆境胁迫;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
冯冠楠;安聪;丁鋆嘉;张夏香;庄黎丽
作者机构：
南京农业大学,江苏 南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]冯冠楠;安聪;丁鋆嘉;张夏香;庄黎丽-.狗尾草GASA基因家族鉴定及其在不同逆境下表达模式分析)[J].草地学报,2022(06):1379-1387
A类：
arabidopsis
B类：
狗尾草,GASA,基因家族鉴定,表达模式分析,Gibberellic,acid,stimulated,小分子,植物激素,激素信号,信号转导,植物体,研究意义,Setaria,viridis,C4,见报,生物信息学技术,全基因组序列,生物信息学分析,家族基因,基因结构,结构简单,模体,基因启动子区,高盐,顺式作用元件,聚乙二醇,冷害,盐害,mM,NaCl,逆境胁迫,草叶,基因表达模式,功能解析
AB值：
0.291001
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