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典型文献
紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
文献摘要:
Ca2+/H+反向转运蛋白(CAX)是一类重要的跨膜转运蛋白,在调控植物Ca2+平衡、抵抗非生物胁迫和转运重金属离子等方面具有重要作用.利用生物信息学方法在全基因组水平对紫花苜蓿CAX基因家族进行了鉴定,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系、顺式作用元件、染色体定位等进行了分析.结果表明,在紫花苜蓿全基因组中共筛选鉴定出15个MsCAX基因,分布于紫花苜蓿15条染色体上,发生22对基因片段重复事件,编码367~460个氨基酸,等电点为5.2~6.5,且均表现为疏水性蛋白.系统进化关系分析结果表明,MsCAXs分为2个亚家族,同一亚家族成员具有相似的基因结构、保守基序和跨膜结构域数量.MsCAXs启动子区域存在光响应性、激素反应性和胁迫响应元件.利用qRT-PCR分析了6个MsCAXs基因在非生物胁迫下的表达模式,结果表明,在干旱和低温胁迫下,6个MsCAX基因均显著下调表达,在盐和盐碱胁迫下,3个MsCAX基因上调表达.说明在不同的非生物胁迫下,MsCAXs基因表现出不同的表达模式.研究结果为进一步探索紫花苜蓿CAX基因家族的功能提供了参考.
文献关键词:
紫花苜蓿;CAX基因家族;全基因组;非生物胁迫;基因表达
作者姓名:
张国香;郭卫冷;毕铭钰;张力爽;王丹;郭长虹
作者机构:
黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室,哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江 哈尔滨 150000
文献出处:
引用格式:
[1]张国香;郭卫冷;毕铭钰;张力爽;王丹;郭长虹-.紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析)[J].草业学报,2022(12):106-117
A类:
MsCAX,MsCAXs
B类:
紫花苜蓿,基因家族鉴定,非生物胁迫,响应分析,Ca2+,H+,反向转运,跨膜转运蛋白,抗非,重金属离子,利用生物,生物信息学方法,全基因组,系统进化,进化关系,顺式作用元件,染色体定位,筛选鉴定,等电点,疏水性,关系分析,亚家族,基因结构,保守基序,跨膜结构域,启动子区域,光响应性,反应性,胁迫响应,响应元,qRT,表达模式,低温胁迫,盐碱胁迫,基因表现
AB值:
0.235017
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