典型文献
小细胞肺癌转移相关miRNAs的生物信息学分析
文献摘要：
目的 分析小细胞肺癌(SCLC)转移相关miRNAs的靶基因及靶蛋白功能，为早期诊断和治疗SCLC寻找到相关生物标志物提供生物信息学参考。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中搜索并下载SCLC转移基因芯片数据，筛选差异性表达的miRNAs，通过TargetScan 7.1，miRDB，miRWalk预测差异miRNAs的靶基因。通过在线网站DAVID软件对交集基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。使用STRING数据库构建交集基因的蛋白互作分析。结果 Qlucore Omics Explorer 3.0分析筛选出21个SCLC转移差异miRNAs (P<0.05；|Fold change|≥2)。通过GO和KEGG分析发现，上述差异表达miRNAs 的靶基因功能主要富集于在Ras、PI3K-Akt、Rap1等信号通路，并参与了细胞黏附、胞吞等过程。靶基因STAT3、SMAD3、MAPK9、E2F1、MMP2、AKT2编码的蛋白在互作网络中具有核心地位。结论 21个miRNAs可能在SCLC转移过程中发挥重要作用，生物信息学分析预测有助于进一步认识miRNA在SCLC转移过程中的功能。
文献关键词：
生物信息学分析;小细胞肺癌;肿瘤转移;miRNAs
中图分类号：
作者姓名：
刘蓉;刘敏
作者机构：
石河子大学医学院，新疆 石河子 832000;新疆军区总医院，新疆 乌鲁木齐 830000
文献出处：
引用格式：
[1]刘蓉;刘敏-.小细胞肺癌转移相关miRNAs的生物信息学分析)[J].世界最新医学信息文摘（连续型电子期刊）,2022(06):27-31
A类：
Qlucore
B类：
小细胞肺癌,肺癌转移,移相,miRNAs,生物信息学分析,SCLC,靶基因,靶蛋白,蛋白功能,诊断和治疗,生物标志物,基因表达综合数据库,GEO,下载,基因芯片,差异性表达,TargetScan,miRDB,miRWalk,线网,DAVID,交集,功能富集分析,通路富集分析,STRING,数据库构建,建交,蛋白互作分析,Omics,Explorer,Fold,change,差异表达,基因功能,Ras,PI3K,Akt,Rap1,细胞黏附,胞吞,STAT3,SMAD3,MAPK9,E2F1,MMP2,AKT2,互作网络,核心地位,分析预测,肿瘤转移
AB值：
0.454734
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