典型文献
基于生物信息学分析筛选银屑病的关键基因
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法筛选银屑病的关健基因及所在信号通路,探讨其发病机制.方法 从开源性基因表达综合数据库(NCBI-GEO)中获取3个银屑病皮损和非皮损活检样本的相关数据集.利用R语言GEO Query和Limma包筛选3个数据集中差异基因(DEGs),通过R语言clusterProfiler包对DEGs进行生物学过程、信号通路分析,最后通过Cytoscape3.6.0软件做出蛋白-蛋白互作网络分析并筛选关键基因.结果 3个数据集取交集共获得共计297个共同差异基因,其中184个上调DEGs和113个下调DEGs;筛选出的10个关键基因,均为上调表达基因;KEGG信号通路主要富集于IL-17信号通路、病毒蛋白与细胞因子/受体互作通路以及趋化因子信号通路;GOBP主要富集在趋化因子的生物学过程中.结论 趋化因子及IL-17信号通路可能在银屑病的发生发展中起着重要作用,为其分子机制、诊断和生物学治疗提供指导.
文献关键词：
银屑病;生物信息学;IL-17信号通路;趋化因子
中图分类号：
作者姓名：
任静静;石瑛;智艳芳;杨博;李肖甫
作者机构：
郑州大学第三附属医院输血科,河南 郑州 450052;郑州大学第三附属医院检验科 ,河南 郑州 450052
文献出处：
引用格式：
[1]任静静;石瑛;智艳芳;杨博;李肖甫-.基于生物信息学分析筛选银屑病的关键基因)[J].医学信息,2022(24):1-6
A类：
B类：
生物信息学分析,银屑病,关键基因,利用生物,生物信息学方法,关健,开源,基因表达综合数据库,NCBI,GEO,皮损,活检,Query,Limma,差异基因,DEGs,clusterProfiler,生物学过程,通路分析,Cytoscape3,蛋白互作网络分析,选关,交集,共获,表达基因,病毒蛋白,趋化因子,GOBP
AB值：
0.300913
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