典型文献
长链非编码RNA-Keratin 8的调控通路分析
文献摘要：
目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-细胞角蛋白8(KRT8)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-KRT8在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-KRT8有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集;在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集.结果 在miRDB数据库预测到15个miRNAs与lncRNA-KRT8相作用,Starbase3.0数据库预测到60个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集共获得2个miRNAs;GO功能注释显示lncRNA-KRT8通过hsa-miR-150-5p作用的靶基因主要调控蛋白结合、RNA结合、金属离子结合信号通路、转录调控作用及蛋白质的磷酸化过程;通过hsa-miR-512-3p作用的靶基因主要调控蛋白结合、DNA结合、金属离子的结合信号通路、蛋白质的泛素化降解过程;通过hsa-miR-150-5p主要调控ErbB信号通路、肿瘤中糖蛋白信号通路、miRNAs、胃癌信号通路等;通过hsa-miR-512-3p作用的信号通路主要是乙型肝炎、人T细胞白血病病毒、前列腺癌、胰岛素抵抗和MAPK信号通路等.结论 长链非编码RNA-KRT8在细胞内的调控作用具体与蛋白质的结合和金属离子结合及糖蛋白、脂代谢信号通路密切相关,其可通过上述作用通路调控疾病的病理进展.
文献关键词：
lncRNA-KRT8;肿瘤;靶基因;信号通路
中图分类号：
作者姓名：
袁晓霞;蒋振
作者机构：
川北医学院基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室,四川 南充 637000
文献出处：
引用格式：
[1]袁晓霞;蒋振-.长链非编码RNA-Keratin 8的调控通路分析)[J].医学信息,2022(19):6-10
A类：
KRT8,Starbase3
B类：
长链非编码,Keratin,调控通路,通路分析,生物信息学分析,细胞角蛋白,调控靶基因,生物学功能,功能注释,lncRNA,功能作用,miRDB,互作关系,交集,miRNAs,Pathway,通路富集,共获,hsa,5p,调控蛋白,蛋白结合,金属离子,离子结合,转录调控,磷酸化,酸化过程,3p,泛素化,降解过程,ErbB,糖蛋白,胃癌,乙型肝炎,白血病,前列腺癌,胰岛素抵抗,MAPK,脂代谢,述作,作用通路,病理进展
AB值：
0.271327
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