典型文献
基于生物信息学筛选膀胱癌预后相关的关键miRNAs并验证
文献摘要：
目的 筛选并分析与膀胱癌预后相关的关键microRNAs(miRNAs)及其靶基因并进行实验验证.方法 从TCGA数据库中下载膀胱癌及正常组织的miRNAs数据及相应的预后信息;利用edgeR包、survival包获取既存在表达差异又有OS临床预后意义的miRNAs分子;将优选的miRNAs进行临床相关性分析,得到关键miRNAs.利用3大常用miRNA预测靶基因的数据库(miRDB、miRWalk、TargetScan)预测关键miRNAs的靶基因,采用DAVID数据库对靶基因进行GO和KEGG富集分析.qRT-PCR检测关键miRNA在膀胱癌细胞中的表达水平;通过转染过表达T24细胞中miR-1307-5p和miR-944,检测细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡能力的变化.结果 从TCGA数据库中共下载418例膀胱癌及19例正常对照的miRNA数据,共筛选出293个差异miRNAs,高表达224个和低表达69个.通过单因素分析优选出与患者预后显著相关的9个miRNAs分子,进一步分析出与患者临床病理信息密切相关的2个miRNA,分别为miR-1307-5p和miR-944.GO和KEGG分析显示,这些miRNAs的靶基因主要与细胞内的细胞质、细胞器以及金属阳离子的结合有关,并且参与了多种与致癌相关的信号通路.qRT-PCR分析显示,miR-944在膀胱癌细胞中的表达下调(P<0.05),miR-1307-5p的表达水平无明显变化(P>0.05);过表达miR-944可抑制膀胱癌细胞增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡,但过表达miR-1307-5p后膀胱癌细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡无明显变化.结论 基于生物信息学分析获得具有重要临床意义的2个关键miRNAs分子,分别是miR-1307-5p和miR-944,其中miR-944可以抑制膀胱癌细胞的生物行为,可能作为膀胱癌潜在的治疗靶点.
文献关键词：
膀胱肿瘤;miRNA;生物信息学;miR-944
中图分类号：
作者姓名：
邹震海;程琪;李中;刘贝贝;高五岳;孙巍;郭园园;刘建民
作者机构：
蚌埠医学院第一附属医院泌尿外科,安徽 蚌埠 233004
文献出处：
引用格式：
[1]邹震海;程琪;李中;刘贝贝;高五岳;孙巍;郭园园;刘建民-.基于生物信息学筛选膀胱癌预后相关的关键miRNAs并验证)[J].医学信息,2022(22):1-8
A类：
B类：
膀胱癌预后,miRNAs,microRNAs,靶基因,TCGA,下载,正常组织,edgeR,survival,既存,表达差异,OS,临床预后,预后意义,临床相关性,miRDB,miRWalk,TargetScan,DAVID,对靶,富集分析,qRT,膀胱癌细胞,转染,过表达,T24,5p,正常对照,低表达,临床病理,细胞质,细胞器,金属阳离子,致癌,可抑制,迁移和侵袭,细胞的增殖,生物信息学分析,生物行为,治疗靶点,膀胱肿瘤
AB值：
0.273689
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