典型文献
hsa-miR-200 c-3 p的靶基因预测及生物信息学分析
文献摘要：
目的:采用生物信息学方法对hsa-miR-200c-3p进行靶基因预测及功能分析,为进一步研究其在肿瘤中的作用和发生机制提供思路.方法:分析miR-200c-3p在不同物种间的保守性及hsa-miR-200c-3p在不同器官和疾病中的表达情况;miRDB和Target Scan预测hsa-miR-200c-3p靶基因,取其交集,合并已经实验证实的靶基因.采用DAVID 6.8数据库对基因集合进行GO功能和KEGG通路富集分析.结果:miR-200c-3p序列在物种间高度保守.hsa-miR-200c-3p在膀胱、胃肠道、脑、四肢、肺、前列腺等组织中表达丰度较高;与正常组织相比,在膀胱癌、卵巢癌、肺癌、前列腺癌等疾病中表达水平较高.包括已被实验证实的靶基因,共得到79个候选基因,主要参与调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、基因表达、细胞增殖、信号转导等生物学过程,涉及前列腺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾癌等疾病相关通路,以及PI3K-Akt、Ras等肿瘤相关信号通路.结论:hsa-miR-200c-3p功能广泛,参与人类生命活动和疾病过程,与癌症的发生、发展密切相关.
文献关键词：
hsa-miR-200c-3p;靶基因预测;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
苏倩;郑宏;王娟;王栋洋
作者机构：
湘南学院临床学院,湖南省郴州市 423000;湘南学院附属医院
文献出处：
引用格式：
[1]苏倩;郑宏;王娟;王栋洋-.hsa-miR-200 c-3 p的靶基因预测及生物信息学分析)[J].医学理论与实践,2022(24):4148-4152
A类：
B类：
hsa,靶基因预测,生物信息学分析,生物信息学方法,200c,3p,功能分析,发生机制,种间,保守性,不同器官,miRDB,Target,Scan,交集,DAVID,通路富集分析,四肢,组织中表达,正常组织,膀胱癌,卵巢癌,前列腺癌,候选基因,启动子,信号转导,生物学过程,小细胞肺癌,胰腺癌,肾癌,疾病相关,相关通路,PI3K,Akt,Ras,肿瘤相关,参与人,生命活动
AB值：
0.298162
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