典型文献
心源性脑梗死和冠心病共表达差异基因的识别和其潜在的miRNA靶点
文献摘要：
目的:应用生物信息学方法分析心源性脑梗死和冠心病之间共有差异基因的识别及其潜在的mRNA靶点分析,在分子水平上探讨心源性脑梗死和冠心病之间的关联和差异.方法:从基因表达综合数据库(Gene expression omnibus)下载基因芯片GSE58294和GSE23561,用R语言对芯片进行标化及差异基因的筛选,运用DAVID数据库对筛选出的差异基因进行基因本体富集分析和京都基因和基因百科全书通路分析,通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并采用Cytoscape软件筛选关键基因,使用在线数据库进行广泛的miRNA靶点预测和在线网络分析.结果:我们在心源性脑梗死数据集中发现了1693个差异基因,在冠心病数据集中发现了2735差异基因.进一步筛选显示,有126个基因是共表达.其中,XAB2,CD79A,CD74,POLR2K是关键基因.对关键基因进行miRNA的预测,如miR-939-5p,其联合关键基因的表达可能与冠心病-心源性脑梗死相关.结论:采用生物信息学分析心源性脑梗死和冠心病所识别的共有基因及其预测的miRNA靶点可能与冠心病-心源性脑梗死相关,而4个基因预测的miRNA如miR-939-5p可能为冠心病相关的心源性脑梗死治疗靶点或标记物,为进一步深入研究冠心病后预防脑梗死治疗提供了依据和思路.
文献关键词：
心源性脑梗死;冠心病;共表达差异基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张莹丹;陈莉
作者机构：
广西医科大学第一附属医院神经内科 广西南宁 530000
文献出处：
引用格式：
[1]张莹丹;陈莉-.心源性脑梗死和冠心病共表达差异基因的识别和其潜在的miRNA靶点)[J].特别健康,2022(21):17-19
A类：
GSE58294,GSE23561,XAB2,CD79A,POLR2K
B类：
心源性脑梗死,冠心病,共表达差异基因,miRNA,生物信息学方法,共有差异基因,分子水平,联和,基因表达综合数据库,Gene,expression,omnibus,下载,基因芯片,DAVID,基因本体,富集分析,京都,百科全书,通路分析,STRING,数据库构建,蛋白相互作用网络,Cytoscape,选关,关键基因,靶点预测,在线网络,CD74,5p,生物信息学分析,治疗靶点,标记物
AB值：
0.201453
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